RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 USP31Q70CQ4 1352 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 SERTM1A2A2V5 107 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 DGKZQ13574 1117 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 RTN1Q16799 776 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 SEC16BQ96JE7 1060 aa3.22□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa3.22□□□□□ -1.89
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC35F4A4IF30 521 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 MSX1P28360 303 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 GPC1P35052 558 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 ENPP3O14638 875 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 FGRP09769 529 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 C9orf131Q5VYM1 1079 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 C12orf49Q9H741 205 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-218ENST00000509368 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-218ENST00000509368 SCO2A0A1W2PP80 73 aa3.19□□□□□ -1.9
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