RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	SPO1	P53541	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	TEP1	P53916	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	SEC5	P89102	971 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	SKY1	Q03656	742 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	ATG33	Q06485	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	RKM4	Q12504	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	CDC16	P09798	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	MSH1	P25846	959 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	SLC1	P33333	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	YKL107W	P34251	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	MCD4	P36051	919 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	PIM1	P36775	1133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	YBR225W	P38321	900 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
IKS1	YJL057C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	FIR1	P40020	876 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	YJL068C	P40363	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	ZIP2	P53061	704 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	HST1	P53685	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	FDC1	Q03034	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	TFC6	Q06339	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	ISU2	Q12056	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	STE6	P12866	1290 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	MNE1	P24720	663 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	ATG19	P35193	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	DID4	P36108	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	RDH54	P38086	958 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	DYS1	P38791	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	HXT7	P39004	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	NPR2	P39923	615 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	QDR2	P40474	542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	SMK1	P41808	388 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	CAF16	P43569	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	HXT10	P43581	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	PEX13	P80667	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	MDL1	P33310	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	BSD2	P38356	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	YJR098C	P47139	656 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	YNL165W	P53891	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	RIA1	P53893	1110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	TIM50	Q02776	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	VID22	Q05934	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	ARP7	Q12406	477 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MET17	P06106	444 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	CKA1	P15790	372 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	HOP1	P20050	605 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.64	not detected
IKS1	YJL057C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.64	not detected
IKS1	YJL057C	ERT1	P38140	529 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	HSM3	P38348	480 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	LAM1	P38851	1228 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MID1	P41821	548 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	GYP8	P43570	497 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ISU1	Q03020	165 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	PHO92	Q06390	306 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	VHS3	Q08438	674 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	TRM8	Q12009	286 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MTF2	P10849	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ENA1	P13587	1091 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ROX1	P25042	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MSH3	P25336	1018 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	GPI10	P30777	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	FMP10	P40098	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	AGX1	P43567	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
IKS1	YJL057C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ENT3	P47160	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ASK10	P48361	1146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	PEX25	Q02969	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MRPL25	P23369	157 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	SED4	P25365	1065 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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