RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem143Q8VD26 458 aa15.85■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ubn2Q80WC1 1314 aa15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 1810065E05RikQ5NC41 235 aa15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ciao1Q99KN2 339 aa15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ttc14Q9CSP9 761 aa15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plekho1Q9JIY0 408 aa15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccne2Q9Z238 404 aa15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc38a10Q5I012 1090 aa15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfyve9A2A8R0 1397 aa15.84■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rbbp8nlA2ABX0 614 aa15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atp2b3Q0VF55 1220 aa15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppm1gQ61074 542 aa15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc39a11Q8BWY7 342 aa15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ipo9Q91YE6 1041 aa15.83■□□□□ 0.13
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NppbP40753 121 aa15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Golim4Q8BXA1 655 aa15.83■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc4a1P04919 929 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atp8a2P98200 1148 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rgs17Q9QZB0 210 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm7347D3YYI9 267 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pde8bE9Q4S1 865 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Speer4aF8VPX6 267 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IntuQ059U7 942 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tshz3Q8CGV9 1081 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa15.82■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 1700029H14RikE9PY36 240 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam102bQ8BQS4 339 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dnai1Q8C0M8 701 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sytl4Q9R0Q1 673 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Myh1Q5SX40 1942 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf496Q5SXI5 585 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Asap2Q7SIG6 958 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 AtrnQ9WU60 1428 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rabep1O35551 862 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TsksO54887 585 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lgr5Q9Z1P4 907 aa15.81■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Casp1P29452 402 aa15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IncenpQ9WU62 880 aa15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Krt25Q8VCW2 446 aa15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ly75Q60767 1723 aa15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MecomP14404 1042 aa15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mdm2P23804 489 aa15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Celf1P28659 486 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 NpeppsQ11011 920 aa15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sptlc3Q8BG54 563 aa15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hoxa7P02830 229 aa15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plbd2Q3TCN2 594 aa15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Jakmip1Q8BVL9 626 aa15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem266Q8BZB3 538 aa15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pus3Q9JI38 481 aa15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kif23E9Q5G3 953 aa15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Naa16Q9DBB4 864 aa15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rps8P62242 208 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TnksQ6PFX9 1320 aa15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PnnO35691 725 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rhot2Q8JZN7 620 aa15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Chmp4cQ9D7F7 232 aa15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pde3bQ61409 1100 aa15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mlh1Q9JK91 760 aa15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ube4aE9Q735 1028 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmc1Q8R4P5 757 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Speer4dL7N216 212 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nlrp9aQ66X03 949 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adarb2Q9JI20 745 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pram1Q6BCL1 675 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 HlfQ8BW74 295 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Arap2Q8BZ05 1703 aa15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc6D3YZP9 469 aa15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sept1P42209 366 aa15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plekhf1Q3TB82 279 aa15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Top1mtQ8R4U6 593 aa15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 C4bP01029 1738 aa15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Apba2P98084 750 aa15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ell2Q3UKU1 639 aa15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ddx11Q6AXC6 880 aa15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 St5Q924W7 1134 aa15.75■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nphp3Q7TNH6 1325 aa15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wdhd1P59328 1117 aa15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kiaa0753Q6A000 959 aa15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sptbn5F6UCX4 1208 aa15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dok7Q18PE0 504 aa15.74■□□□□ 0.11
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.8 ms