Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.17■■■■■ 5.14
Casp1P29452 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Casp1P29452 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Casp1P29452 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
Casp1P29452 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
Casp1P29452 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Casp1P29452 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Casp1P29452 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Casp1P29452 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Casp1P29452 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Casp1P29452 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Casp1P29452 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
Casp1P29452 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Casp1P29452 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Casp1P29452 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Casp1P29452 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Casp1P29452 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Casp1P29452 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Casp1P29452 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Casp1P29452 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Casp1P29452 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Casp1P29452 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Casp1P29452 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Casp1P29452 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Casp1P29452 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Casp1P29452 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Casp1P29452 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Casp1P29452 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Casp1P29452 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Casp1P29452 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Casp1P29452 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Casp1P29452 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Casp1P29452 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Casp1P29452 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Casp1P29452 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Casp1P29452 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Casp1P29452 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Casp1P29452 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Casp1P29452 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Casp1P29452 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Casp1P29452 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Casp1P29452 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Casp1P29452 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Casp1P29452 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Casp1P29452 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Casp1P29452 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Casp1P29452 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Casp1P29452 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Casp1P29452 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Casp1P29452 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Casp1P29452 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Casp1P29452 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Casp1P29452 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Casp1P29452 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Casp1P29452 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Casp1P29452 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Casp1P29452 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Casp1P29452 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Casp1P29452 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Casp1P29452 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Casp1P29452 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Casp1P29452 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Casp1P29452 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Casp1P29452 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Casp1P29452 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Casp1P29452 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Casp1P29452 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Casp1P29452 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Casp1P29452 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Casp1P29452 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Casp1P29452 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Casp1P29452 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Casp1P29452 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Casp1P29452 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Casp1P29452 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Casp1P29452 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Casp1P29452 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Casp1P29452 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Casp1P29452 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Casp1P29452 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Casp1P29452 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Casp1P29452 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Casp1P29452 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Casp1P29452 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Casp1P29452 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Casp1P29452 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Casp1P29452 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Casp1P29452 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Casp1P29452 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Casp1P29452 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Casp1P29452 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Casp1P29452 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Casp1P29452 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Casp1P29452 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Casp1P29452 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Casp1P29452 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Casp1P29452 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Casp1P29452 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Casp1P29452 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Casp1P29452 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms