Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47,17■■■■■ 5,14
Casp1P29452 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43,67■■■■■ 4,58
Casp1P29452 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
Casp1P29452 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41,13■■■■■ 4,17
Casp1P29452 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40,91■■■■■ 4,14
Casp1P29452 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40,24■■■■■ 4,03
Casp1P29452 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Casp1P29452 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Casp1P29452 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
Casp1P29452 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
Casp1P29452 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,53■■■■□ 3,92
Casp1P29452 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39,34■■■■□ 3,89
Casp1P29452 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Casp1P29452 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,89■■■■□ 3,82
Casp1P29452 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Casp1P29452 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38,21■■■■□ 3,71
Casp1P29452 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Casp1P29452 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37,97■■■■□ 3,67
Casp1P29452 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,95■■■■□ 3,67
Casp1P29452 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37,93■■■■□ 3,66
Casp1P29452 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Casp1P29452 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,76■■■■□ 3,64
Casp1P29452 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,63
Casp1P29452 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Casp1P29452 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Casp1P29452 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Casp1P29452 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Casp1P29452 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Casp1P29452 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Casp1P29452 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37,27■■■■□ 3,56
Casp1P29452 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Casp1P29452 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Casp1P29452 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37,17■■■■□ 3,54
Casp1P29452 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Casp1P29452 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37,12■■■■□ 3,53
Casp1P29452 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,96■■■■□ 3,51
Casp1P29452 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Casp1P29452 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Casp1P29452 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Casp1P29452 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Casp1P29452 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36,26■■■■□ 3,4
Casp1P29452 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Casp1P29452 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Casp1P29452 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC36,02■■■■□ 3,36
Casp1P29452 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
Casp1P29452 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Casp1P29452 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Casp1P29452 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Casp1P29452 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,34
Casp1P29452 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,82■■■■□ 3,32
Casp1P29452 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Casp1P29452 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35,67■■■■□ 3,3
Casp1P29452 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Casp1P29452 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Casp1P29452 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35,58■■■■□ 3,29
Casp1P29452 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Casp1P29452 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Casp1P29452 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Casp1P29452 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35,4■■■■□ 3,26
Casp1P29452 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Casp1P29452 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Casp1P29452 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Casp1P29452 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Casp1P29452 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Casp1P29452 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Casp1P29452 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Casp1P29452 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Casp1P29452 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Casp1P29452 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Casp1P29452 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Casp1P29452 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Casp1P29452 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Casp1P29452 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,97■■■■□ 3,19
Casp1P29452 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Casp1P29452 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Casp1P29452 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Casp1P29452 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,85■■■■□ 3,17
Casp1P29452 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,8■■■■□ 3,16
Casp1P29452 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,78■■■■□ 3,16
Casp1P29452 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Casp1P29452 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Casp1P29452 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Casp1P29452 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Casp1P29452 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Casp1P29452 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34,68■■■■□ 3,14
Casp1P29452 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Casp1P29452 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Casp1P29452 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,65■■■■□ 3,14
Casp1P29452 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Casp1P29452 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34,6■■■■□ 3,13
Casp1P29452 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34,55■■■■□ 3,12
Casp1P29452 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Casp1P29452 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Casp1P29452 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34,5■■■■□ 3,11
Casp1P29452 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,45■■■■□ 3,11
Casp1P29452 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,42■■■■□ 3,1
Casp1P29452 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,42■■■■□ 3,1
Casp1P29452 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Casp1P29452 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,32■■■■□ 3,08
Casp1P29452 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms