RNA–Protein interactions for RNA: tM(CAU)C

tM(CAU)C, Transcript of Methionine tRNA (tRNA-Met), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tM(CAU)C, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tM(CAU)CtM(CAU)C VPS35P34110 944 aa13.57□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C PCM1P38628 557 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C THI6P41835 540 aa13.57□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C VTC3Q02725 835 aa13.57□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C IRC10Q08118 586 aa13.57□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C RRD2Q12461 358 aa13.57□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C HAP2P06774 265 aa13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data13.56□□□□□ -0.24not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C URA1P28272 314 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C RAD54P32863 898 aa13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C MNN4P36044 1178 aa13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C TTI1P36097 1038 aa13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C SAF1P38352 637 aa13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C ORC5P50874 479 aa13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C RCR2Q03446 210 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C YML083CQ04526 418 aa13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C PLP2Q12017 286 aa13.56□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C PGI1P12709 554 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C RAD27P26793 382 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C PRR1P28708 518 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C YSC83P32792 385 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C YKL097CP34245 136 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C MAL33P38157 468 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C DAK2P43550 591 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C YDL057WQ07379 328 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C SHS1Q07657 551 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C REC8Q12188 680 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C OSH2Q12451 1283 aa13.55□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C FOB1O13329 566 aa13.54□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C RPL4AP10664 362 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C RGP1P16664 663 aa13.54□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C RPC31P17890 251 aa13.54□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C UBP13P38187 747 aa13.54□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C YTA12P40341 825 aa13.54□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C RPL4BP49626 362 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C NUT1P53114 1132 aa13.54□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C SPE1P08432 466 aa13.53□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C PPS1P38148 807 aa13.53□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C ULI1P43604 169 aa13.53□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C YGR130CP53278 816 aa13.53□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C VPS20Q04272 221 aa13.53□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
tM(CAU)CtM(CAU)C HXK1P04806 485 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C TAF13P11747 167 aa13.52□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C MMS4P38257 691 aa13.52□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C FAR11P53917 953 aa13.52□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C FAP1P53971 965 aa13.52□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C MCM3P24279 971 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C SIS1P25294 352 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C HMT1P38074 348 aa13.51□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C SHE10P53075 577 aa13.51□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C COG8Q04632 607 aa13.51□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C CCH1P50077 2039 aa13.51□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C HIS4P00815 799 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C ATP1P07251 545 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C MAS1P10507 462 aa13.5□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C CYS3P31373 394 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C YEL1P34225 687 aa13.5□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data13.5□□□□□ -0.25not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C CUR1Q06469 252 aa13.5□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C SDH5Q08230 162 aa13.5□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C PUP3P25451 205 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C PGS1P25578 521 aa13.49□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C PRX1P34227 261 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C BIO5P53744 561 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C SEC5P89102 971 aa13.49□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C PML39Q03760 334 aa13.49□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C UTP14Q04500 899 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C PCK1P10963 549 aa13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C DAL7P21826 554 aa13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C RDS1P25611 832 aa13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C RIM4P38741 713 aa13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C ASN1P49089 572 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C SPC98P53540 846 aa13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C SNU56Q03782 492 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C YDR344CQ05510 147 aa13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C PSR2Q07949 397 aa13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C YPL277CQ08989 487 aa13.48□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C RAM1P22007 431 aa13.47□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C SPO11P23179 398 aa13.47□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C VPH1P32563 840 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C TRM2P33753 639 aa13.47□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C NPA3P47122 385 aa13.47□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C STP1Q00947 519 aa13.47□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C CDC53Q12018 815 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C SIP5P40210 489 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C YFL034WP43564 1073 aa13.46□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C VTC2P43585 828 aa13.46□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C POL31P46957 487 aa13.46□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C CTF3Q12748 733 aa13.46□□□□□ -0.25
tM(CAU)CtM(CAU)C HMG2P12684 1045 aa13.45□□□□□ -0.26
tM(CAU)CtM(CAU)C PDE1P22434 369 aa13.45□□□□□ -0.26
tM(CAU)CtM(CAU)C COY1P34237 679 aa13.45□□□□□ -0.26
tM(CAU)CtM(CAU)C UBP5P39944 805 aa13.45□□□□□ -0.26
tM(CAU)CtM(CAU)C CDD1Q06549 142 aa13.45□□□□□ -0.26
tM(CAU)CtM(CAU)C PHO8P11491 566 aa13.44□□□□□ -0.26
tM(CAU)CtM(CAU)C YBR284WP38150 797 aa13.44□□□□□ -0.26
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