RNA–Protein interactions for RNA: YOR348C

PUT4, Transcript of Proline permease, yeast

Gene PUT4, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUT4	YOR348C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	NIT1	P40447	199 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	PXA1	P41909	870 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YJR039W	P47107	1121 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	BRO1	P48582	844 aa		15.2	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	RAD54	P32863	898 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	RIM8	P53179	542 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	EEB1	Q02891	456 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	PHM6	Q05637	104 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	CUR1	Q06469	252 aa		15.19	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	FIS1	P40515	155 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	ATG20	Q07528	640 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YLR462W	O13556	202 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YHL049C	P38722	271 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YEL075C	P39972	122 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YER189W	P40104	122 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YFL064C	P43540	174 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	NMD5	P46970	1048 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YML037C	Q03703	340 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		15.18	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	CTR1	P49573	406 aa		15.17	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YSC83	P32792	385 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	EXO5	P38289	585 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	HIS2	P38635	335 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	ERC1	P38767	581 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	PSY2	P40164	858 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	ENV11	P53246	860 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YDR278C	Q05612	105 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	CRD1	Q07560	283 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.16	■□□□□ 0.02	not detected
PUT4	YOR348C	KIP1	P28742	1111 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	ATG36	P46983	293 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	TDA9	Q04545	1251 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	SLX4	Q12098	748 aa		15.16	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	OAF3	P36023	863 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	RRT2	P38332	387 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	YMR187C	Q03236	431 aa		15.15	■□□□□ 0.02
PUT4	YOR348C	TGL1	P34163	548 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	YDL206W	Q12424	762 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.14	■□□□□ 0.01	not detected
PUT4	YOR348C	YGR117C	P53270	476 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	DON1	Q05610	365 aa		15.14	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	CDC11	P32458	415 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	USA1	Q03714	838 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	PNP1	Q05788	311 aa		15.13	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	GLC3	P32775	704 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	SAP185	P40856	1058 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	FET4	P40988	552 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	NCR1	Q12200	1170 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	SAK1	P38990	1142 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	DSN1	P40568	576 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	VPS70	P47161	811 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	PIG1	Q06216	648 aa		15.12	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	RRN6	P32786	894 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	YSW1	P38280	609 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	SPC72	P39723	622 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	URB2	P47108	1174 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	CLA4	P48562	842 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	TAM41	P53230	385 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	SPH1	Q06160	661 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	GUD1	Q07729	489 aa		15.11	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	SEY1	Q99287	776 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	JIP3	O13555	125 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	SHP1	P34223	423 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	ATG19	P35193	415 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	MRX1	P40050	688 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	YDR338C	Q05497	695 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	FRA1	Q07825	749 aa		15.1	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	15.09	■□□□□ 0.01
PUT4	YOR348C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.09	■□□□□ 0.01	not detected

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