RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	NUP120	P35729	1037 aa		5.9	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	ALG14	P38242	237 aa		5.9	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YHR218W	P38899	603 aa		5.9	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	NUT1	P53114	1132 aa		5.9	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	CTR9	P89105	1077 aa		5.9	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	MED1	Q12321	566 aa		5.9	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	NPR1	P22211	790 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	DUR3	P33413	735 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	MXR1	P40029	184 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	XKS1	P42826	600 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YFL066C	P43538	392 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YNR063W	P53749	607 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	TDA6	Q06466	467 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	GAL1	P04385	528 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	FUS1	P11710	512 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	IMP2'	P32351	346 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	MCM10	P32354	571 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	PLC1	P32383	869 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	EUG1	P32474	517 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	TFC4	P33339	1025 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	SQT1	P35184	431 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	RKM3	P38222	552 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	RSM26	P47141	266 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	EEB1	Q02891	456 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	SSP2	Q08646	371 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	SAC3	P46674	1301 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	HUL4	P40985	892 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	CNN1	P43618	361 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YJL181W	P46987	611 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	BNA1	P47096	177 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	GPG1	P53130	126 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	ERP6	P53198	216 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YNL193W	P53870	558 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YRF1-2	P40105	1681 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	ARE1	P25628	610 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	NIC96	P34077	839 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YKL133C	P36066	463 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	TFA2	P36145	328 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	IML2	P47031	731 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	PEX13	P80667	386 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YMR187C	Q03236	431 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	MSH6	Q03834	1242 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	GIS4	Q04233	774 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YMR018W	Q04364	514 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	MLC2	Q06580	163 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	OPY2	Q06810	360 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	MDM38	Q08179	573 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	SLP1	Q12232	587 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	HSP78	P33416	811 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	POP2	P39008	433 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	SGM1	P47166	707 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	HFD1	Q04458	532 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YPL191C	Q08930	360 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YDR056C	Q12025	205 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	DBF20	P32328	564 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	ESL2	P36168	1195 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	PEX28	P38848	579 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	NSE5	Q03718	556 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	EAF1	Q06337	982 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	FMP25	Q08023	583 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YMD8	YML038C	HVG1	P0CE11	249 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YMD8	YML038C	MRP8	P35719	219 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YMD8	YML038C	VBA5	P36172	582 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YMD8	YML038C	BAP2	P38084	609 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YMD8	YML038C	VPS8	P39702	1274 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YMD8	YML038C	RTA1	P53047	317 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YMD8	YML038C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YMD8	YML038C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YMD8	YML038C	YDR286C	Q05530	114 aa		5.83	□□□□□ -1.48

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