RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	CDC55	Q00362	526 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	DAL4	Q04895	635 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	TOS4	Q06266	489 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RGA2	Q06407	1009 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ADE8	P04161	214 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	POL3	P15436	1097 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RPB10	P22139	70 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	KRE6	P32486	720 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	BDF1	P35817	686 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	EFM2	P38347	419 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YLF2	P38746	405 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	STL1	P39932	569 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	VHR1	P40522	640 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	IRC6	P43615	237 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	TIM10	P87108	93 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	FDC1	Q03034	503 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ARR2	Q06597	130 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	HIM1	Q06674	414 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SFI1	Q12369	946 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	AI4	P03878	556 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RPC82	P32349	654 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	DUT1	P33317	147 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MTG2	P38860	518 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CIR1	P42940	261 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ALR2	P43553	858 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SHE4	P51534	789 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CIK1	Q01649	594 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RRN11	Q04712	507 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RTT10	Q08924	1013 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MDY2	Q12285	212 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CDC16	P09798	840 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
SET1	YHR119W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	AFR1	P33304	620 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	BET3	P36149	193 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RTS1	P38903	757 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YJL068C	P40363	299 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SKP2	P42843	763 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YAP1802	P53309	568 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RTC4	P53850	401 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YMR155W	Q03795	547 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YDR131C	Q03899	556 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	BRE4	Q07660	1125 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YLR001C	Q07895	862 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YVC1	Q12324	675 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	FRE6	Q12473	712 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YLR358C	O13565	187 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SWI6	P09959	803 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ISC10	P32645	267 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YKU70	P32807	602 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SLC1	P33333	303 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SIT1	P39980	628 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	BUD16	P39988	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	FTR1	P40088	404 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MDR1	P53258	950 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YGR273C	P53329	174 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YNR061C	P53747	219 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YNL144C	P53907	740 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ARP5	P53946	755 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	FCP1	Q03254	732 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RMT2	Q03305	412 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RMP1	Q12530	201 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SEC39	Q12745	709 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	MET8	P15807	274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	VPS3	P23643	1011 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	VBA3	P25594	458 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	NPL6	P32832	435 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	LCB2	P40970	561 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	QRI7	P43122	407 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	YGR266W	P53326	701 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	RSC4	Q02206	625 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SET1	YHR119W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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