RNA–Protein interactions for RNA: YFL007W

BLM10, Transcript of Proteasome activator, yeast

Gene BLM10, Length 6,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLM10	YFL007W	MCM2	P29469	868 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	APS3	P47064	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RET3	P53600	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PLP1	Q04004	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	OM45	P16547	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PTP2	P29461	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MNT4	P53745	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TSR4	P25040	408 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YIL001W	P40560	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	IRC6	P43615	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RAD17	P48581	401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SPO21	Q12411	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	HMX1	P32339	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NIC96	P34077	839 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RCK2	P38623	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PES4	P39684	611 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ALG2	P43636	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	VTI1	Q04338	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ATP16	Q12165	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SRB8	P25648	1427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	DOM34	P33309	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TBS1	P38114	1094 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ECM1	P39715	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NUT1	P53114	1132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
BLM10	YFL007W	VPS16	Q03308	798 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CBF1	P17106	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CBF2	P32504	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CIN4	P39110	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RMI1	Q02685	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YAP6	Q03935	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CIT1	P00890	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	UBP13	P38187	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	GCN3	P14741	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	FUI1	P38196	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TFB4	Q12004	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	INH1	P01097	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RAD7	P06779	565 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SWI5	P08153	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RNP1	P32385	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YMR262W	P38430	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RAD55	P38953	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MOG1	P47123	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RSC58	Q07979	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	GLG1	P36143	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	EFM2	P38347	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	YHR054C	P38780	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	PRM2	P40534	656 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	DAK2	P43550	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TAF8	Q03750	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	DBF2	P22204	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SWC5	P38326	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	BET4	Q00618	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	CMP2	P14747	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	GRR1	P24814	1151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	RAD16	P31244	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	FZO1	P38297	855 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BLM10	YFL007W	FMC1	P40491	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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