RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567283.5

RPUSD1-209, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, human

TSL 3

Gene RPUSD1, Length 835 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		32.17	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	PARP10	Q53GL7	1025 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	JDP2	Q8WYK2	163 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	PSMD1	Q99460	953 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	ANXA1	P04083	346 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	SNED1	Q8TER0	1413 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	CREBZF	Q9NS37	354 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPUSD1-209	ENST00000567283	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.13	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	PDIA6	Q15084	440 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	FZD9	O00144	591 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	EPHX2	P34913	555 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	LAMB2	P55268	1798 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	GPC2	Q8N158	579 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	COL4A5	P29400	1685 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		32.08	■■■□□ 2.73
RPUSD1-209	ENST00000567283	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	SLC51A	Q86UW1	340 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	PASK	Q96RG2	1323 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	KRT24	Q2M2I5	525 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	NIM1K	Q8IY84	436 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	ABCC4	O15439	1325 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	TNS4	Q8IZW8	715 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.02	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	CNTNAP1	P78357	1384 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	LTBP1	Q14766	1721 aa		32.01	■■■□□ 2.72
RPUSD1-209	ENST00000567283	PPIP5K2	O43314	1243 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		32	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	CHL1	O00533	1208 aa		32	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	AOC3	Q16853	763 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	CNTROB	Q8N137	903 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	ZNF428	Q96B54	188 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	CAPN15	O75808	1086 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPUSD1-209	ENST00000567283	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	TAF1	P21675	1872 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	SCNN1D	P51172	638 aa		31.93	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	HOXB7	P09629	217 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	EPS15	P42566	896 aa		31.92	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	BBOX1	O75936	387 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	MPND	Q8N594	471 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	VEGFB	P49765	207 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	GRAP	Q13588	217 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	VPS33B	Q9H267	617 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	SP8	Q8IXZ3	490 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RPUSD1-209	ENST00000567283	AIDA	Q96BJ3	306 aa		31.89	■■■□□ 2.7

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