RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nfatc4Q8K120 901 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl25Q8R2P1 589 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1461Q8VEV7 312 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspa14Q99M31 509 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fis1Q9CQ92 152 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcun1d5Q9CXV9 237 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Isoc2bQ9DCC7 210 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fads2Q9Z0R9 444 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssc4dA1L0T3 586 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4a32A2A8T1 509 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actl10A2AKE7 346 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam83cA2ARK0 776 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1040A2ARY1 313 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr592E9PYB3 312 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp607bG3X9H3 648 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srp54P14576 504 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbx2P48031 348 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nat3P50296 290 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd3P58545 530 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stard6P59096 233 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps26P62855 115 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myl12aQ6ZWQ9 172 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slitrk5Q810B7 957 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Palm2Q8BR92 376 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hcar1Q8C131 343 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp51a1Q8K0C4 503 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf130Q8VEM1 419 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr541Q8VGM0 312 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox4i2Q91W29 172 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AgtrapQ9WVK0 161 aa11.93□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r9A2RST7 299 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tceal7A3KGA4 98 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm14139F6ZS36 494 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl9F7BE40 171 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sod2P09671 222 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FurinP23188 793 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tia1P52912 386 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alg10bQ3UGP8 474 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf44Q3UHJ8 407 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt76Q3UV17 594 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cr1lQ64735 483 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prrg3Q6PAQ9 231 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gramd2bQ6PEM6 445 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r140Q7TQA4 312 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mon1bQ8BMQ8 553 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dppa4Q8CCG4 296 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stx19Q8R1Q0 292 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SdslQ8R238 329 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr308Q8VFP2 308 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcf19Q99KJ5 263 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zswim7Q9CWQ2 152 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mdm1Q9D067 708 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stx11Q9D3G5 287 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam174aQ9D3L0 190 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdrt4Q9DA64 179 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pop7Q9DCH2 140 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ak4Q9WUR9 223 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r10W4VSP8 311 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prune2Q52KR3 3084 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr634-ps1A0A1B0GRN7 318 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700023F06RikA2AB62 382 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itga10E9Q6R1 1167 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r16K7N775 303 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a2O55192 617 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd3b1P24815 373 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rph3aP47708 681 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cav3P51637 151 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab8bP61028 207 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EvlP70429 414 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il12rb2P97378 874 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tigd2Q0VBL1 525 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MedagQ14BA6 303 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ffar3Q3UFD7 319 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc26a10Q5EBI0 492 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Satb1Q60611 764 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smad2Q62432 467 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5416Q6IE28 97 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-M10.5Q85ZW7 330 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Enpp6Q8BGN3 440 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gramd1cQ8CI52 457 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tma7Q8K003 64 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TrhdeQ8K093 1025 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc58Q8R3Q6 144 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mzt2Q9CQ25 159 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Susd3Q9D176 269 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dgat1Q9Z2A7 498 aa11.92□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1306A2BFL7 312 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SelenonD3Z2R5 557 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Reps1O54916 795 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcb1aP21447 1276 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxd11P23813 323 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ThpoP40226 356 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnj5P48545 419 aa11.91□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Opn1swP51491 346 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.1 ms