Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,72■■■■□ 3,15
Rab8bP61028 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Rab8bP61028 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Rab8bP61028 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Rab8bP61028 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Rab8bP61028 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,32■■■□□ 2,6
Rab8bP61028 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Rab8bP61028 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
Rab8bP61028 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Rab8bP61028 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Rab8bP61028 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Rab8bP61028 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Rab8bP61028 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Rab8bP61028 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Rab8bP61028 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,39■■■□□ 2,3
Rab8bP61028 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Rab8bP61028 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Rab8bP61028 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Rab8bP61028 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Rab8bP61028 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Rab8bP61028 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Rab8bP61028 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Rab8bP61028 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Rab8bP61028 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Rab8bP61028 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Rab8bP61028 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Rab8bP61028 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Rab8bP61028 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rab8bP61028 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Rab8bP61028 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Rab8bP61028 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Rab8bP61028 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Rab8bP61028 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Rab8bP61028 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Rab8bP61028 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rab8bP61028 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Rab8bP61028 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Rab8bP61028 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Rab8bP61028 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Rab8bP61028 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Rab8bP61028 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Rab8bP61028 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Rab8bP61028 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Rab8bP61028 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rab8bP61028 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Rab8bP61028 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Rab8bP61028 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Rab8bP61028 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Rab8bP61028 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Rab8bP61028 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Rab8bP61028 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Rab8bP61028 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rab8bP61028 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Rab8bP61028 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rab8bP61028 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Rab8bP61028 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Rab8bP61028 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Rab8bP61028 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Rab8bP61028 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Rab8bP61028 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Rab8bP61028 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rab8bP61028 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rab8bP61028 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rab8bP61028 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Rab8bP61028 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Rab8bP61028 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rab8bP61028 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rab8bP61028 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,92■■□□□ 1,9
Rab8bP61028 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Rab8bP61028 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rab8bP61028 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rab8bP61028 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Rab8bP61028 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,83■■□□□ 1,88
Rab8bP61028 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Rab8bP61028 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Rab8bP61028 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Rab8bP61028 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rab8bP61028 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Rab8bP61028 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Rab8bP61028 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Rab8bP61028 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Rab8bP61028 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Rab8bP61028 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Rab8bP61028 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Rab8bP61028 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Rab8bP61028 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Rab8bP61028 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Rab8bP61028 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rab8bP61028 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rab8bP61028 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Rab8bP61028 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Rab8bP61028 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Rab8bP61028 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Rab8bP61028 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Rab8bP61028 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rab8bP61028 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Rab8bP61028 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Rab8bP61028 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rab8bP61028 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rab8bP61028 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,4 ms