Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Rab8bP61028 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rab8bP61028 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rab8bP61028 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rab8bP61028 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Rab8bP61028 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Rab8bP61028 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rab8bP61028 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Rab8bP61028 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Rab8bP61028 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rab8bP61028 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Rab8bP61028 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rab8bP61028 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rab8bP61028 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab8bP61028 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rab8bP61028 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab8bP61028 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab8bP61028 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab8bP61028 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rab8bP61028 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rab8bP61028 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rab8bP61028 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rab8bP61028 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rab8bP61028 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rab8bP61028 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab8bP61028 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab8bP61028 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab8bP61028 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rab8bP61028 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rab8bP61028 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab8bP61028 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rab8bP61028 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rab8bP61028 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rab8bP61028 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rab8bP61028 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rab8bP61028 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab8bP61028 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab8bP61028 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rab8bP61028 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rab8bP61028 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rab8bP61028 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rab8bP61028 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab8bP61028 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rab8bP61028 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab8bP61028 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rab8bP61028 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab8bP61028 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rab8bP61028 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rab8bP61028 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rab8bP61028 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab8bP61028 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab8bP61028 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rab8bP61028 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rab8bP61028 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab8bP61028 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rab8bP61028 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab8bP61028 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab8bP61028 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rab8bP61028 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab8bP61028 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab8bP61028 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab8bP61028 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rab8bP61028 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rab8bP61028 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rab8bP61028 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rab8bP61028 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab8bP61028 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rab8bP61028 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rab8bP61028 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab8bP61028 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab8bP61028 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab8bP61028 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab8bP61028 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rab8bP61028 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab8bP61028 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab8bP61028 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab8bP61028 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rab8bP61028 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rab8bP61028 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rab8bP61028 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rab8bP61028 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rab8bP61028 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rab8bP61028 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rab8bP61028 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab8bP61028 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rab8bP61028 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rab8bP61028 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rab8bP61028 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab8bP61028 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab8bP61028 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rab8bP61028 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rab8bP61028 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab8bP61028 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rab8bP61028 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab8bP61028 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab8bP61028 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab8bP61028 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rab8bP61028 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab8bP61028 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rab8bP61028 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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