Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Stx19Q8R1Q0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Stx19Q8R1Q0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Stx19Q8R1Q0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Stx19Q8R1Q0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Stx19Q8R1Q0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Stx19Q8R1Q0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Stx19Q8R1Q0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Stx19Q8R1Q0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Stx19Q8R1Q0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Stx19Q8R1Q0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Stx19Q8R1Q0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Stx19Q8R1Q0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Stx19Q8R1Q0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Stx19Q8R1Q0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Stx19Q8R1Q0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Stx19Q8R1Q0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Stx19Q8R1Q0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Stx19Q8R1Q0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Stx19Q8R1Q0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Stx19Q8R1Q0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Stx19Q8R1Q0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Stx19Q8R1Q0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Stx19Q8R1Q0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Stx19Q8R1Q0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Stx19Q8R1Q0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Stx19Q8R1Q0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Stx19Q8R1Q0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Stx19Q8R1Q0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Stx19Q8R1Q0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Stx19Q8R1Q0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stx19Q8R1Q0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stx19Q8R1Q0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stx19Q8R1Q0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Stx19Q8R1Q0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stx19Q8R1Q0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Stx19Q8R1Q0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Stx19Q8R1Q0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stx19Q8R1Q0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stx19Q8R1Q0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stx19Q8R1Q0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stx19Q8R1Q0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stx19Q8R1Q0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Stx19Q8R1Q0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stx19Q8R1Q0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Stx19Q8R1Q0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Stx19Q8R1Q0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stx19Q8R1Q0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stx19Q8R1Q0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stx19Q8R1Q0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stx19Q8R1Q0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stx19Q8R1Q0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx19Q8R1Q0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Stx19Q8R1Q0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx19Q8R1Q0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stx19Q8R1Q0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stx19Q8R1Q0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stx19Q8R1Q0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Stx19Q8R1Q0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Stx19Q8R1Q0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stx19Q8R1Q0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Stx19Q8R1Q0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Stx19Q8R1Q0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stx19Q8R1Q0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stx19Q8R1Q0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stx19Q8R1Q0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stx19Q8R1Q0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stx19Q8R1Q0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stx19Q8R1Q0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx19Q8R1Q0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stx19Q8R1Q0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stx19Q8R1Q0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stx19Q8R1Q0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Stx19Q8R1Q0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stx19Q8R1Q0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Stx19Q8R1Q0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Stx19Q8R1Q0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stx19Q8R1Q0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stx19Q8R1Q0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stx19Q8R1Q0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stx19Q8R1Q0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stx19Q8R1Q0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stx19Q8R1Q0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Stx19Q8R1Q0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Stx19Q8R1Q0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stx19Q8R1Q0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stx19Q8R1Q0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stx19Q8R1Q0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stx19Q8R1Q0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Stx19Q8R1Q0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stx19Q8R1Q0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx19Q8R1Q0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx19Q8R1Q0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx19Q8R1Q0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stx19Q8R1Q0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx19Q8R1Q0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stx19Q8R1Q0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stx19Q8R1Q0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stx19Q8R1Q0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stx19Q8R1Q0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms