Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2P1

Klhl25, Kelch-like protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl25Q8R2P1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Klhl25Q8R2P1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Klhl25Q8R2P1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Klhl25Q8R2P1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Klhl25Q8R2P1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Klhl25Q8R2P1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Klhl25Q8R2P1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Klhl25Q8R2P1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Klhl25Q8R2P1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Klhl25Q8R2P1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Klhl25Q8R2P1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Klhl25Q8R2P1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Klhl25Q8R2P1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Klhl25Q8R2P1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klhl25Q8R2P1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Klhl25Q8R2P1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Klhl25Q8R2P1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Klhl25Q8R2P1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Klhl25Q8R2P1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Klhl25Q8R2P1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Klhl25Q8R2P1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Klhl25Q8R2P1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Klhl25Q8R2P1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klhl25Q8R2P1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Klhl25Q8R2P1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Klhl25Q8R2P1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Klhl25Q8R2P1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Klhl25Q8R2P1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Klhl25Q8R2P1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Klhl25Q8R2P1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Klhl25Q8R2P1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Klhl25Q8R2P1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Klhl25Q8R2P1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Klhl25Q8R2P1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Klhl25Q8R2P1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Klhl25Q8R2P1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Klhl25Q8R2P1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Klhl25Q8R2P1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Klhl25Q8R2P1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Klhl25Q8R2P1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Klhl25Q8R2P1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Klhl25Q8R2P1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Klhl25Q8R2P1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Klhl25Q8R2P1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Klhl25Q8R2P1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Klhl25Q8R2P1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Klhl25Q8R2P1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Klhl25Q8R2P1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Klhl25Q8R2P1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klhl25Q8R2P1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Klhl25Q8R2P1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Klhl25Q8R2P1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Klhl25Q8R2P1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Klhl25Q8R2P1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Klhl25Q8R2P1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Klhl25Q8R2P1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Klhl25Q8R2P1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Klhl25Q8R2P1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Klhl25Q8R2P1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Klhl25Q8R2P1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Klhl25Q8R2P1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Klhl25Q8R2P1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klhl25Q8R2P1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klhl25Q8R2P1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Klhl25Q8R2P1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Klhl25Q8R2P1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Klhl25Q8R2P1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klhl25Q8R2P1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl25Q8R2P1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl25Q8R2P1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl25Q8R2P1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl25Q8R2P1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhl25Q8R2P1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhl25Q8R2P1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl25Q8R2P1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl25Q8R2P1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl25Q8R2P1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl25Q8R2P1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl25Q8R2P1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl25Q8R2P1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl25Q8R2P1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl25Q8R2P1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl25Q8R2P1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl25Q8R2P1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl25Q8R2P1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl25Q8R2P1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl25Q8R2P1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl25Q8R2P1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl25Q8R2P1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl25Q8R2P1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl25Q8R2P1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl25Q8R2P1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Klhl25Q8R2P1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl25Q8R2P1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl25Q8R2P1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Klhl25Q8R2P1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl25Q8R2P1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl25Q8R2P1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Klhl25Q8R2P1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Klhl25Q8R2P1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms