Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ9

Myl12a, MCG5400, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl12aQ6ZWQ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Myl12aQ6ZWQ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
Myl12aQ6ZWQ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Myl12aQ6ZWQ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Myl12aQ6ZWQ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Myl12aQ6ZWQ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Myl12aQ6ZWQ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Myl12aQ6ZWQ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Myl12aQ6ZWQ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Myl12aQ6ZWQ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Myl12aQ6ZWQ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Myl12aQ6ZWQ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Myl12aQ6ZWQ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Myl12aQ6ZWQ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Myl12aQ6ZWQ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Myl12aQ6ZWQ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Myl12aQ6ZWQ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Myl12aQ6ZWQ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Myl12aQ6ZWQ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Myl12aQ6ZWQ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Myl12aQ6ZWQ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Myl12aQ6ZWQ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Myl12aQ6ZWQ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Myl12aQ6ZWQ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Myl12aQ6ZWQ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Myl12aQ6ZWQ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Myl12aQ6ZWQ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Myl12aQ6ZWQ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Myl12aQ6ZWQ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Myl12aQ6ZWQ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Myl12aQ6ZWQ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Myl12aQ6ZWQ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Myl12aQ6ZWQ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Myl12aQ6ZWQ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Myl12aQ6ZWQ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Myl12aQ6ZWQ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Myl12aQ6ZWQ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Myl12aQ6ZWQ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Myl12aQ6ZWQ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Myl12aQ6ZWQ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Myl12aQ6ZWQ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Myl12aQ6ZWQ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Myl12aQ6ZWQ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Myl12aQ6ZWQ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Myl12aQ6ZWQ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Myl12aQ6ZWQ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Myl12aQ6ZWQ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Myl12aQ6ZWQ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
Myl12aQ6ZWQ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Myl12aQ6ZWQ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Myl12aQ6ZWQ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Myl12aQ6ZWQ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Myl12aQ6ZWQ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Myl12aQ6ZWQ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Myl12aQ6ZWQ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Myl12aQ6ZWQ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Myl12aQ6ZWQ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Myl12aQ6ZWQ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Myl12aQ6ZWQ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Myl12aQ6ZWQ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Myl12aQ6ZWQ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Myl12aQ6ZWQ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Myl12aQ6ZWQ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Myl12aQ6ZWQ9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Myl12aQ6ZWQ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Myl12aQ6ZWQ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Myl12aQ6ZWQ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Myl12aQ6ZWQ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Myl12aQ6ZWQ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Myl12aQ6ZWQ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Myl12aQ6ZWQ9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Myl12aQ6ZWQ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Myl12aQ6ZWQ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Myl12aQ6ZWQ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Myl12aQ6ZWQ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Myl12aQ6ZWQ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Myl12aQ6ZWQ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Myl12aQ6ZWQ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Myl12aQ6ZWQ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Myl12aQ6ZWQ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Myl12aQ6ZWQ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Myl12aQ6ZWQ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Myl12aQ6ZWQ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Myl12aQ6ZWQ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Myl12aQ6ZWQ9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Myl12aQ6ZWQ9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Myl12aQ6ZWQ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Myl12aQ6ZWQ9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Myl12aQ6ZWQ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Myl12aQ6ZWQ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Myl12aQ6ZWQ9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Myl12aQ6ZWQ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Myl12aQ6ZWQ9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Myl12aQ6ZWQ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Myl12aQ6ZWQ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Myl12aQ6ZWQ9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Myl12aQ6ZWQ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Myl12aQ6ZWQ9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Myl12aQ6ZWQ9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Myl12aQ6ZWQ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms