Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ9

Myl12a, MCG5400, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl12aQ6ZWQ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Myl12aQ6ZWQ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Myl12aQ6ZWQ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Myl12aQ6ZWQ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Myl12aQ6ZWQ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Myl12aQ6ZWQ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Myl12aQ6ZWQ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Myl12aQ6ZWQ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myl12aQ6ZWQ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Myl12aQ6ZWQ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Myl12aQ6ZWQ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Myl12aQ6ZWQ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myl12aQ6ZWQ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Myl12aQ6ZWQ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myl12aQ6ZWQ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Myl12aQ6ZWQ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Myl12aQ6ZWQ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Myl12aQ6ZWQ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myl12aQ6ZWQ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Myl12aQ6ZWQ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myl12aQ6ZWQ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myl12aQ6ZWQ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Myl12aQ6ZWQ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Myl12aQ6ZWQ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myl12aQ6ZWQ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Myl12aQ6ZWQ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myl12aQ6ZWQ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myl12aQ6ZWQ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Myl12aQ6ZWQ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Myl12aQ6ZWQ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myl12aQ6ZWQ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Myl12aQ6ZWQ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Myl12aQ6ZWQ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Myl12aQ6ZWQ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Myl12aQ6ZWQ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myl12aQ6ZWQ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Myl12aQ6ZWQ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myl12aQ6ZWQ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myl12aQ6ZWQ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myl12aQ6ZWQ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myl12aQ6ZWQ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Myl12aQ6ZWQ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Myl12aQ6ZWQ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Myl12aQ6ZWQ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Myl12aQ6ZWQ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Myl12aQ6ZWQ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Myl12aQ6ZWQ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Myl12aQ6ZWQ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Myl12aQ6ZWQ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myl12aQ6ZWQ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myl12aQ6ZWQ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myl12aQ6ZWQ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myl12aQ6ZWQ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myl12aQ6ZWQ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myl12aQ6ZWQ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Myl12aQ6ZWQ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Myl12aQ6ZWQ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Myl12aQ6ZWQ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Myl12aQ6ZWQ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Myl12aQ6ZWQ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Myl12aQ6ZWQ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Myl12aQ6ZWQ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myl12aQ6ZWQ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myl12aQ6ZWQ9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Myl12aQ6ZWQ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myl12aQ6ZWQ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myl12aQ6ZWQ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myl12aQ6ZWQ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Myl12aQ6ZWQ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Myl12aQ6ZWQ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Myl12aQ6ZWQ9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Myl12aQ6ZWQ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Myl12aQ6ZWQ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Myl12aQ6ZWQ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Myl12aQ6ZWQ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Myl12aQ6ZWQ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Myl12aQ6ZWQ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Myl12aQ6ZWQ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Myl12aQ6ZWQ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Myl12aQ6ZWQ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Myl12aQ6ZWQ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Myl12aQ6ZWQ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Myl12aQ6ZWQ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Myl12aQ6ZWQ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Myl12aQ6ZWQ9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Myl12aQ6ZWQ9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Myl12aQ6ZWQ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Myl12aQ6ZWQ9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl12aQ6ZWQ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Myl12aQ6ZWQ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Myl12aQ6ZWQ9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Myl12aQ6ZWQ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Myl12aQ6ZWQ9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Myl12aQ6ZWQ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Myl12aQ6ZWQ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Myl12aQ6ZWQ9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Myl12aQ6ZWQ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Myl12aQ6ZWQ9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myl12aQ6ZWQ9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myl12aQ6ZWQ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms