Protein–RNA interactions for Protein: K7N775

Vmn1r16, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r16K7N775 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Vmn1r16K7N775 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Vmn1r16K7N775 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Vmn1r16K7N775 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Vmn1r16K7N775 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Vmn1r16K7N775 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Vmn1r16K7N775 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Vmn1r16K7N775 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Vmn1r16K7N775 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Vmn1r16K7N775 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Vmn1r16K7N775 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Vmn1r16K7N775 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Vmn1r16K7N775 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Vmn1r16K7N775 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Vmn1r16K7N775 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Vmn1r16K7N775 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Vmn1r16K7N775 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Vmn1r16K7N775 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Vmn1r16K7N775 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Vmn1r16K7N775 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Vmn1r16K7N775 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Vmn1r16K7N775 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Vmn1r16K7N775 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Vmn1r16K7N775 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Vmn1r16K7N775 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Vmn1r16K7N775 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Vmn1r16K7N775 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Vmn1r16K7N775 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Vmn1r16K7N775 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Vmn1r16K7N775 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Vmn1r16K7N775 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Vmn1r16K7N775 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Vmn1r16K7N775 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Vmn1r16K7N775 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Vmn1r16K7N775 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Vmn1r16K7N775 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Vmn1r16K7N775 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Vmn1r16K7N775 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,76■■□□□ 1,88
Vmn1r16K7N775 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Vmn1r16K7N775 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Vmn1r16K7N775 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Vmn1r16K7N775 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Vmn1r16K7N775 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vmn1r16K7N775 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Vmn1r16K7N775 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Vmn1r16K7N775 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Vmn1r16K7N775 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Vmn1r16K7N775 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Vmn1r16K7N775 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Vmn1r16K7N775 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Vmn1r16K7N775 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Vmn1r16K7N775 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Vmn1r16K7N775 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,23■■□□□ 1,79
Vmn1r16K7N775 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Vmn1r16K7N775 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Vmn1r16K7N775 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Vmn1r16K7N775 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Vmn1r16K7N775 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Vmn1r16K7N775 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Vmn1r16K7N775 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Vmn1r16K7N775 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Vmn1r16K7N775 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26■■□□□ 1,75
Vmn1r16K7N775 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Vmn1r16K7N775 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Vmn1r16K7N775 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Vmn1r16K7N775 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Vmn1r16K7N775 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Vmn1r16K7N775 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Vmn1r16K7N775 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Vmn1r16K7N775 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Vmn1r16K7N775 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Vmn1r16K7N775 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Vmn1r16K7N775 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Vmn1r16K7N775 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Vmn1r16K7N775 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Vmn1r16K7N775 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Vmn1r16K7N775 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Vmn1r16K7N775 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Vmn1r16K7N775 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Vmn1r16K7N775 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Vmn1r16K7N775 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Vmn1r16K7N775 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Vmn1r16K7N775 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Vmn1r16K7N775 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Vmn1r16K7N775 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Vmn1r16K7N775 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Vmn1r16K7N775 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Vmn1r16K7N775 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Vmn1r16K7N775 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Vmn1r16K7N775 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Vmn1r16K7N775 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Vmn1r16K7N775 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Vmn1r16K7N775 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Vmn1r16K7N775 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Vmn1r16K7N775 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Vmn1r16K7N775 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Vmn1r16K7N775 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Vmn1r16K7N775 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Vmn1r16K7N775 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Vmn1r16K7N775 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms