Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,73■■■■□ 3,63
H2-M10.5Q85ZW7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
H2-M10.5Q85ZW7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,98■■■□□ 2,87
H2-M10.5Q85ZW7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,68■■■□□ 2,82
H2-M10.5Q85ZW7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
H2-M10.5Q85ZW7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
H2-M10.5Q85ZW7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
H2-M10.5Q85ZW7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
H2-M10.5Q85ZW7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,51■■■□□ 2,63
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
H2-M10.5Q85ZW7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,27■■■□□ 2,6
H2-M10.5Q85ZW7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
H2-M10.5Q85ZW7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
H2-M10.5Q85ZW7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,48■■■□□ 2,47
H2-M10.5Q85ZW7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
H2-M10.5Q85ZW7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,43■■■□□ 2,46
H2-M10.5Q85ZW7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,3■■■□□ 2,44
H2-M10.5Q85ZW7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
H2-M10.5Q85ZW7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
H2-M10.5Q85ZW7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
H2-M10.5Q85ZW7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
H2-M10.5Q85ZW7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
H2-M10.5Q85ZW7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
H2-M10.5Q85ZW7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
H2-M10.5Q85ZW7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
H2-M10.5Q85ZW7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
H2-M10.5Q85ZW7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,69■■■□□ 2,34
H2-M10.5Q85ZW7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
H2-M10.5Q85ZW7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,28■■■□□ 2,28
H2-M10.5Q85ZW7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,21■■■□□ 2,27
H2-M10.5Q85ZW7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,06■■■□□ 2,24
H2-M10.5Q85ZW7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
H2-M10.5Q85ZW7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
H2-M10.5Q85ZW7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
H2-M10.5Q85ZW7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,86■■■□□ 2,21
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,81■■■□□ 2,2
H2-M10.5Q85ZW7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
H2-M10.5Q85ZW7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
H2-M10.5Q85ZW7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
H2-M10.5Q85ZW7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
H2-M10.5Q85ZW7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
H2-M10.5Q85ZW7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
H2-M10.5Q85ZW7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
H2-M10.5Q85ZW7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
H2-M10.5Q85ZW7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
H2-M10.5Q85ZW7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
H2-M10.5Q85ZW7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
H2-M10.5Q85ZW7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
H2-M10.5Q85ZW7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
H2-M10.5Q85ZW7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
H2-M10.5Q85ZW7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
H2-M10.5Q85ZW7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
H2-M10.5Q85ZW7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,07■■■□□ 2,08
H2-M10.5Q85ZW7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
H2-M10.5Q85ZW7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
H2-M10.5Q85ZW7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
H2-M10.5Q85ZW7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,01■■■□□ 2,07
H2-M10.5Q85ZW7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
H2-M10.5Q85ZW7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,98■■■□□ 2,07
H2-M10.5Q85ZW7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
H2-M10.5Q85ZW7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,98■■■□□ 2,07
H2-M10.5Q85ZW7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
H2-M10.5Q85ZW7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,89■■■□□ 2,05
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
H2-M10.5Q85ZW7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
H2-M10.5Q85ZW7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
H2-M10.5Q85ZW7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
H2-M10.5Q85ZW7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
H2-M10.5Q85ZW7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
H2-M10.5Q85ZW7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
H2-M10.5Q85ZW7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
H2-M10.5Q85ZW7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
H2-M10.5Q85ZW7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
H2-M10.5Q85ZW7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
H2-M10.5Q85ZW7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
H2-M10.5Q85ZW7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,63■■■□□ 2,01
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,55■■■□□ 2
H2-M10.5Q85ZW7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
H2-M10.5Q85ZW7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
H2-M10.5Q85ZW7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms