Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Gbx2P48031 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gbx2P48031 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gbx2P48031 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gbx2P48031 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Gbx2P48031 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gbx2P48031 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gbx2P48031 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gbx2P48031 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gbx2P48031 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gbx2P48031 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Gbx2P48031 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gbx2P48031 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gbx2P48031 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gbx2P48031 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gbx2P48031 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gbx2P48031 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Gbx2P48031 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gbx2P48031 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gbx2P48031 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gbx2P48031 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gbx2P48031 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gbx2P48031 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gbx2P48031 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gbx2P48031 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gbx2P48031 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gbx2P48031 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gbx2P48031 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gbx2P48031 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gbx2P48031 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Gbx2P48031 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gbx2P48031 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gbx2P48031 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gbx2P48031 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gbx2P48031 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gbx2P48031 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gbx2P48031 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gbx2P48031 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gbx2P48031 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gbx2P48031 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gbx2P48031 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbx2P48031 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gbx2P48031 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gbx2P48031 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gbx2P48031 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gbx2P48031 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gbx2P48031 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gbx2P48031 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gbx2P48031 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gbx2P48031 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gbx2P48031 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gbx2P48031 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gbx2P48031 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gbx2P48031 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gbx2P48031 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gbx2P48031 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gbx2P48031 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gbx2P48031 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gbx2P48031 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gbx2P48031 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gbx2P48031 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gbx2P48031 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gbx2P48031 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gbx2P48031 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gbx2P48031 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gbx2P48031 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gbx2P48031 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gbx2P48031 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gbx2P48031 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gbx2P48031 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gbx2P48031 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gbx2P48031 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gbx2P48031 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gbx2P48031 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gbx2P48031 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gbx2P48031 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbx2P48031 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbx2P48031 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gbx2P48031 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbx2P48031 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gbx2P48031 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gbx2P48031 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbx2P48031 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gbx2P48031 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gbx2P48031 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gbx2P48031 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gbx2P48031 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gbx2P48031 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gbx2P48031 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gbx2P48031 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gbx2P48031 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gbx2P48031 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gbx2P48031 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gbx2P48031 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gbx2P48031 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gbx2P48031 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gbx2P48031 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gbx2P48031 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gbx2P48031 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbx2P48031 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.5 ms