Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC7

Isoc2b, Isochorismatase domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isoc2bQ9DCC7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,65
Isoc2bQ9DCC7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,33■■■□□ 2,61
Isoc2bQ9DCC7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Isoc2bQ9DCC7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Isoc2bQ9DCC7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Isoc2bQ9DCC7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Isoc2bQ9DCC7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Isoc2bQ9DCC7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Isoc2bQ9DCC7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Isoc2bQ9DCC7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Isoc2bQ9DCC7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Isoc2bQ9DCC7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Isoc2bQ9DCC7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Isoc2bQ9DCC7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Isoc2bQ9DCC7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Isoc2bQ9DCC7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Isoc2bQ9DCC7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Isoc2bQ9DCC7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Isoc2bQ9DCC7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Isoc2bQ9DCC7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Isoc2bQ9DCC7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Isoc2bQ9DCC7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Isoc2bQ9DCC7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Isoc2bQ9DCC7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Isoc2bQ9DCC7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Isoc2bQ9DCC7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Isoc2bQ9DCC7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Isoc2bQ9DCC7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Isoc2bQ9DCC7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Isoc2bQ9DCC7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Isoc2bQ9DCC7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
Isoc2bQ9DCC7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Isoc2bQ9DCC7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Isoc2bQ9DCC7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Isoc2bQ9DCC7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Isoc2bQ9DCC7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Isoc2bQ9DCC7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Isoc2bQ9DCC7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Isoc2bQ9DCC7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Isoc2bQ9DCC7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Isoc2bQ9DCC7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Isoc2bQ9DCC7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Isoc2bQ9DCC7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Isoc2bQ9DCC7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Isoc2bQ9DCC7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Isoc2bQ9DCC7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Isoc2bQ9DCC7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Isoc2bQ9DCC7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Isoc2bQ9DCC7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Isoc2bQ9DCC7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Isoc2bQ9DCC7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Isoc2bQ9DCC7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Isoc2bQ9DCC7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Isoc2bQ9DCC7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Isoc2bQ9DCC7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Isoc2bQ9DCC7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Isoc2bQ9DCC7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Isoc2bQ9DCC7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Isoc2bQ9DCC7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Isoc2bQ9DCC7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Isoc2bQ9DCC7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Isoc2bQ9DCC7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Isoc2bQ9DCC7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Isoc2bQ9DCC7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Isoc2bQ9DCC7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Isoc2bQ9DCC7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Isoc2bQ9DCC7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Isoc2bQ9DCC7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Isoc2bQ9DCC7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Isoc2bQ9DCC7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Isoc2bQ9DCC7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Isoc2bQ9DCC7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Isoc2bQ9DCC7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Isoc2bQ9DCC7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Isoc2bQ9DCC7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Isoc2bQ9DCC7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Isoc2bQ9DCC7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Isoc2bQ9DCC7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Isoc2bQ9DCC7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Isoc2bQ9DCC7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Isoc2bQ9DCC7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Isoc2bQ9DCC7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Isoc2bQ9DCC7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Isoc2bQ9DCC7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Isoc2bQ9DCC7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Isoc2bQ9DCC7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Isoc2bQ9DCC7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Isoc2bQ9DCC7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Isoc2bQ9DCC7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Isoc2bQ9DCC7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Isoc2bQ9DCC7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Isoc2bQ9DCC7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Isoc2bQ9DCC7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Isoc2bQ9DCC7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Isoc2bQ9DCC7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Isoc2bQ9DCC7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Isoc2bQ9DCC7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Isoc2bQ9DCC7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Isoc2bQ9DCC7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Isoc2bQ9DCC7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms