Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Rph3aP47708 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rph3aP47708 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rph3aP47708 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rph3aP47708 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rph3aP47708 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rph3aP47708 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Rph3aP47708 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Rph3aP47708 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Rph3aP47708 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rph3aP47708 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Rph3aP47708 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Rph3aP47708 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rph3aP47708 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rph3aP47708 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rph3aP47708 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Rph3aP47708 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Rph3aP47708 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rph3aP47708 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rph3aP47708 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rph3aP47708 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rph3aP47708 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rph3aP47708 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rph3aP47708 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rph3aP47708 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rph3aP47708 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rph3aP47708 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rph3aP47708 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rph3aP47708 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rph3aP47708 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rph3aP47708 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rph3aP47708 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rph3aP47708 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rph3aP47708 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rph3aP47708 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rph3aP47708 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rph3aP47708 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rph3aP47708 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rph3aP47708 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rph3aP47708 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rph3aP47708 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rph3aP47708 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rph3aP47708 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rph3aP47708 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rph3aP47708 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rph3aP47708 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rph3aP47708 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rph3aP47708 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rph3aP47708 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rph3aP47708 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rph3aP47708 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rph3aP47708 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rph3aP47708 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rph3aP47708 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rph3aP47708 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rph3aP47708 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rph3aP47708 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rph3aP47708 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rph3aP47708 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rph3aP47708 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rph3aP47708 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rph3aP47708 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rph3aP47708 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rph3aP47708 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rph3aP47708 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rph3aP47708 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rph3aP47708 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rph3aP47708 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rph3aP47708 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rph3aP47708 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rph3aP47708 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rph3aP47708 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Rph3aP47708 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rph3aP47708 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rph3aP47708 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rph3aP47708 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rph3aP47708 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rph3aP47708 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rph3aP47708 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rph3aP47708 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rph3aP47708 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rph3aP47708 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rph3aP47708 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rph3aP47708 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rph3aP47708 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rph3aP47708 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rph3aP47708 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rph3aP47708 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rph3aP47708 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rph3aP47708 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rph3aP47708 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rph3aP47708 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rph3aP47708 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rph3aP47708 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rph3aP47708 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rph3aP47708 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rph3aP47708 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rph3aP47708 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rph3aP47708 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rph3aP47708 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms