Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Arl9F7BE40 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Arl9F7BE40 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Arl9F7BE40 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Arl9F7BE40 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Arl9F7BE40 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Arl9F7BE40 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Arl9F7BE40 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Arl9F7BE40 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Arl9F7BE40 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Arl9F7BE40 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Arl9F7BE40 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Arl9F7BE40 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Arl9F7BE40 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Arl9F7BE40 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Arl9F7BE40 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Arl9F7BE40 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Arl9F7BE40 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Arl9F7BE40 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Arl9F7BE40 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Arl9F7BE40 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Arl9F7BE40 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Arl9F7BE40 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Arl9F7BE40 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Arl9F7BE40 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Arl9F7BE40 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Arl9F7BE40 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Arl9F7BE40 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Arl9F7BE40 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Arl9F7BE40 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Arl9F7BE40 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Arl9F7BE40 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Arl9F7BE40 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Arl9F7BE40 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Arl9F7BE40 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Arl9F7BE40 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Arl9F7BE40 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Arl9F7BE40 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Arl9F7BE40 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Arl9F7BE40 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Arl9F7BE40 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Arl9F7BE40 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Arl9F7BE40 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Arl9F7BE40 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Arl9F7BE40 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Arl9F7BE40 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Arl9F7BE40 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Arl9F7BE40 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Arl9F7BE40 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Arl9F7BE40 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arl9F7BE40 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Arl9F7BE40 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Arl9F7BE40 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Arl9F7BE40 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Arl9F7BE40 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arl9F7BE40 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arl9F7BE40 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arl9F7BE40 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Arl9F7BE40 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Arl9F7BE40 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arl9F7BE40 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arl9F7BE40 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Arl9F7BE40 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arl9F7BE40 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Arl9F7BE40 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arl9F7BE40 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arl9F7BE40 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arl9F7BE40 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arl9F7BE40 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Arl9F7BE40 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arl9F7BE40 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arl9F7BE40 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Arl9F7BE40 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Arl9F7BE40 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Arl9F7BE40 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Arl9F7BE40 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Arl9F7BE40 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Arl9F7BE40 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Arl9F7BE40 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Arl9F7BE40 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Arl9F7BE40 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arl9F7BE40 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arl9F7BE40 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Arl9F7BE40 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Arl9F7BE40 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arl9F7BE40 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Arl9F7BE40 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Arl9F7BE40 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Arl9F7BE40 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Arl9F7BE40 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arl9F7BE40 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Arl9F7BE40 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Arl9F7BE40 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Arl9F7BE40 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Arl9F7BE40 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Arl9F7BE40 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arl9F7BE40 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Arl9F7BE40 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Arl9F7BE40 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arl9F7BE40 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms