Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Vmn1r10W4VSP8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Vmn1r10W4VSP8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Vmn1r10W4VSP8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
Vmn1r10W4VSP8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Vmn1r10W4VSP8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Vmn1r10W4VSP8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Vmn1r10W4VSP8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Vmn1r10W4VSP8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Vmn1r10W4VSP8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Vmn1r10W4VSP8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Vmn1r10W4VSP8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Vmn1r10W4VSP8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,28■■■□□ 2,28
Vmn1r10W4VSP8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Vmn1r10W4VSP8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Vmn1r10W4VSP8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Vmn1r10W4VSP8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Vmn1r10W4VSP8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Vmn1r10W4VSP8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Vmn1r10W4VSP8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Vmn1r10W4VSP8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Vmn1r10W4VSP8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Vmn1r10W4VSP8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Vmn1r10W4VSP8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Vmn1r10W4VSP8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Vmn1r10W4VSP8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Vmn1r10W4VSP8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Vmn1r10W4VSP8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Vmn1r10W4VSP8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Vmn1r10W4VSP8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Vmn1r10W4VSP8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Vmn1r10W4VSP8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Vmn1r10W4VSP8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Vmn1r10W4VSP8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Vmn1r10W4VSP8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Vmn1r10W4VSP8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Vmn1r10W4VSP8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Vmn1r10W4VSP8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Vmn1r10W4VSP8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Vmn1r10W4VSP8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Vmn1r10W4VSP8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Vmn1r10W4VSP8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Vmn1r10W4VSP8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Vmn1r10W4VSP8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Vmn1r10W4VSP8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Vmn1r10W4VSP8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Vmn1r10W4VSP8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Vmn1r10W4VSP8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Vmn1r10W4VSP8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Vmn1r10W4VSP8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Vmn1r10W4VSP8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Vmn1r10W4VSP8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Vmn1r10W4VSP8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Vmn1r10W4VSP8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Vmn1r10W4VSP8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Vmn1r10W4VSP8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Vmn1r10W4VSP8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vmn1r10W4VSP8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vmn1r10W4VSP8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Vmn1r10W4VSP8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Vmn1r10W4VSP8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Vmn1r10W4VSP8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Vmn1r10W4VSP8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Vmn1r10W4VSP8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vmn1r10W4VSP8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Vmn1r10W4VSP8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vmn1r10W4VSP8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vmn1r10W4VSP8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Vmn1r10W4VSP8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Vmn1r10W4VSP8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Vmn1r10W4VSP8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vmn1r10W4VSP8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vmn1r10W4VSP8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Vmn1r10W4VSP8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
Vmn1r10W4VSP8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Vmn1r10W4VSP8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Vmn1r10W4VSP8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Vmn1r10W4VSP8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Vmn1r10W4VSP8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Vmn1r10W4VSP8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Vmn1r10W4VSP8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Vmn1r10W4VSP8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Vmn1r10W4VSP8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,14■■□□□ 1,77
Vmn1r10W4VSP8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Vmn1r10W4VSP8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Vmn1r10W4VSP8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Vmn1r10W4VSP8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Vmn1r10W4VSP8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Vmn1r10W4VSP8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Vmn1r10W4VSP8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Vmn1r10W4VSP8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Vmn1r10W4VSP8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Vmn1r10W4VSP8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Vmn1r10W4VSP8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Vmn1r10W4VSP8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Vmn1r10W4VSP8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Vmn1r10W4VSP8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Vmn1r10W4VSP8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Vmn1r10W4VSP8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Vmn1r10W4VSP8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms