Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Vmn1r10W4VSP8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Vmn1r10W4VSP8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Vmn1r10W4VSP8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Vmn1r10W4VSP8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Vmn1r10W4VSP8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Vmn1r10W4VSP8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vmn1r10W4VSP8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Vmn1r10W4VSP8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Vmn1r10W4VSP8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Vmn1r10W4VSP8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Vmn1r10W4VSP8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Vmn1r10W4VSP8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Vmn1r10W4VSP8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vmn1r10W4VSP8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Vmn1r10W4VSP8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vmn1r10W4VSP8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vmn1r10W4VSP8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Vmn1r10W4VSP8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn1r10W4VSP8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vmn1r10W4VSP8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vmn1r10W4VSP8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Vmn1r10W4VSP8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Vmn1r10W4VSP8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vmn1r10W4VSP8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vmn1r10W4VSP8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vmn1r10W4VSP8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vmn1r10W4VSP8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vmn1r10W4VSP8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vmn1r10W4VSP8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vmn1r10W4VSP8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vmn1r10W4VSP8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vmn1r10W4VSP8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vmn1r10W4VSP8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vmn1r10W4VSP8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vmn1r10W4VSP8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vmn1r10W4VSP8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vmn1r10W4VSP8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vmn1r10W4VSP8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vmn1r10W4VSP8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Vmn1r10W4VSP8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn1r10W4VSP8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vmn1r10W4VSP8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vmn1r10W4VSP8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vmn1r10W4VSP8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn1r10W4VSP8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vmn1r10W4VSP8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vmn1r10W4VSP8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vmn1r10W4VSP8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vmn1r10W4VSP8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vmn1r10W4VSP8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vmn1r10W4VSP8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vmn1r10W4VSP8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vmn1r10W4VSP8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r10W4VSP8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vmn1r10W4VSP8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn1r10W4VSP8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r10W4VSP8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r10W4VSP8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vmn1r10W4VSP8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Vmn1r10W4VSP8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Vmn1r10W4VSP8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vmn1r10W4VSP8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vmn1r10W4VSP8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vmn1r10W4VSP8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Vmn1r10W4VSP8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r10W4VSP8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r10W4VSP8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vmn1r10W4VSP8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vmn1r10W4VSP8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vmn1r10W4VSP8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vmn1r10W4VSP8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vmn1r10W4VSP8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vmn1r10W4VSP8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r10W4VSP8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r10W4VSP8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vmn1r10W4VSP8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r10W4VSP8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Vmn1r10W4VSP8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vmn1r10W4VSP8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r10W4VSP8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r10W4VSP8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r10W4VSP8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Vmn1r10W4VSP8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn1r10W4VSP8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn1r10W4VSP8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r10W4VSP8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Vmn1r10W4VSP8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vmn1r10W4VSP8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vmn1r10W4VSP8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r10W4VSP8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r10W4VSP8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r10W4VSP8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn1r10W4VSP8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn1r10W4VSP8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r10W4VSP8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vmn1r10W4VSP8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vmn1r10W4VSP8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vmn1r10W4VSP8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r10W4VSP8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms