Protein–RNA interactions for Protein: P50296

Nat3, Arylamine N-acetyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nat3P50296 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,96■■■□□ 2,87
Nat3P50296 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Nat3P50296 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Nat3P50296 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Nat3P50296 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Nat3P50296 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Nat3P50296 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Nat3P50296 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Nat3P50296 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Nat3P50296 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Nat3P50296 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Nat3P50296 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Nat3P50296 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Nat3P50296 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Nat3P50296 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Nat3P50296 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Nat3P50296 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Nat3P50296 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Nat3P50296 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Nat3P50296 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Nat3P50296 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Nat3P50296 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Nat3P50296 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Nat3P50296 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Nat3P50296 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Nat3P50296 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Nat3P50296 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Nat3P50296 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Nat3P50296 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Nat3P50296 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Nat3P50296 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Nat3P50296 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Nat3P50296 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Nat3P50296 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Nat3P50296 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Nat3P50296 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Nat3P50296 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Nat3P50296 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Nat3P50296 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Nat3P50296 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Nat3P50296 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Nat3P50296 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Nat3P50296 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Nat3P50296 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,4■■□□□ 1,98
Nat3P50296 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Nat3P50296 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Nat3P50296 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Nat3P50296 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Nat3P50296 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Nat3P50296 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Nat3P50296 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Nat3P50296 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Nat3P50296 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Nat3P50296 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Nat3P50296 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Nat3P50296 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Nat3P50296 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Nat3P50296 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Nat3P50296 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Nat3P50296 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Nat3P50296 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Nat3P50296 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Nat3P50296 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Nat3P50296 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Nat3P50296 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Nat3P50296 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Nat3P50296 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Nat3P50296 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Nat3P50296 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Nat3P50296 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Nat3P50296 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Nat3P50296 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Nat3P50296 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Nat3P50296 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Nat3P50296 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Nat3P50296 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Nat3P50296 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Nat3P50296 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Nat3P50296 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Nat3P50296 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Nat3P50296 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Nat3P50296 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Nat3P50296 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Nat3P50296 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Nat3P50296 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Nat3P50296 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Nat3P50296 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Nat3P50296 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Nat3P50296 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Nat3P50296 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Nat3P50296 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Nat3P50296 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Nat3P50296 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Nat3P50296 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Nat3P50296 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Nat3P50296 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Nat3P50296 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Nat3P50296 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Nat3P50296 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Nat3P50296 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms