Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR92

Palm2, Paralemmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm2Q8BR92 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
Palm2Q8BR92 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Palm2Q8BR92 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Palm2Q8BR92 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,1■■■□□ 2,57
Palm2Q8BR92 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Palm2Q8BR92 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Palm2Q8BR92 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Palm2Q8BR92 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Palm2Q8BR92 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Palm2Q8BR92 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Palm2Q8BR92 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Palm2Q8BR92 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Palm2Q8BR92 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Palm2Q8BR92 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Palm2Q8BR92 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Palm2Q8BR92 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
Palm2Q8BR92 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Palm2Q8BR92 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Palm2Q8BR92 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Palm2Q8BR92 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Palm2Q8BR92 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Palm2Q8BR92 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Palm2Q8BR92 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Palm2Q8BR92 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Palm2Q8BR92 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Palm2Q8BR92 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Palm2Q8BR92 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Palm2Q8BR92 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Palm2Q8BR92 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Palm2Q8BR92 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Palm2Q8BR92 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Palm2Q8BR92 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Palm2Q8BR92 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Palm2Q8BR92 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Palm2Q8BR92 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Palm2Q8BR92 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Palm2Q8BR92 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Palm2Q8BR92 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Palm2Q8BR92 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Palm2Q8BR92 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Palm2Q8BR92 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Palm2Q8BR92 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Palm2Q8BR92 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Palm2Q8BR92 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Palm2Q8BR92 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Palm2Q8BR92 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Palm2Q8BR92 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Palm2Q8BR92 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Palm2Q8BR92 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Palm2Q8BR92 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Palm2Q8BR92 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Palm2Q8BR92 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Palm2Q8BR92 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Palm2Q8BR92 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Palm2Q8BR92 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Palm2Q8BR92 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Palm2Q8BR92 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Palm2Q8BR92 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Palm2Q8BR92 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Palm2Q8BR92 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Palm2Q8BR92 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Palm2Q8BR92 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Palm2Q8BR92 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Palm2Q8BR92 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Palm2Q8BR92 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Palm2Q8BR92 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,84
Palm2Q8BR92 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Palm2Q8BR92 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Palm2Q8BR92 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Palm2Q8BR92 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Palm2Q8BR92 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Palm2Q8BR92 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Palm2Q8BR92 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Palm2Q8BR92 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Palm2Q8BR92 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Palm2Q8BR92 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Palm2Q8BR92 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Palm2Q8BR92 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Palm2Q8BR92 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Palm2Q8BR92 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Palm2Q8BR92 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Palm2Q8BR92 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Palm2Q8BR92 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Palm2Q8BR92 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Palm2Q8BR92 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Palm2Q8BR92 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Palm2Q8BR92 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Palm2Q8BR92 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Palm2Q8BR92 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Palm2Q8BR92 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Palm2Q8BR92 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Palm2Q8BR92 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Palm2Q8BR92 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Palm2Q8BR92 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Palm2Q8BR92 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Palm2Q8BR92 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Palm2Q8BR92 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Palm2Q8BR92 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Palm2Q8BR92 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Palm2Q8BR92 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms