RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr37Q8CBE3 496 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd209aQ91ZX1 238 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cby3Q9CVN6 235 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pbdc1Q9D0B6 198 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcemp1Q9D8U6 183 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl15Q9DCL4 406 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap3m1Q9JKC8 418 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ehd3Q9QXY6 535 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dyrk1bQ9Z188 629 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs6Q9Z2H2 472 aa12.01□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tet2Q4JK59 1912 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp352A2AML7 551 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esp31A8R0W3 114 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr521E9Q519 321 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8879F6R3J9 157 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr22F6TNE3 422 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacng1O70578 223 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgfb3P17125 410 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Man2a1P27046 1150 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcadvlP50544 656 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gal3st3P61315 431 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uap1l1Q3TW96 507 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smu1Q3UKJ7 513 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taar7bQ5QD11 358 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11992Q5SS90 291 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snta1Q61234 503 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC080695Q66JY9 481 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HhipQ7TN16 700 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr5Q812A5 387 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl4Q8BH70 621 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BHB7 409 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CcinQ8CDE2 588 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nedd4lQ8CFI0 1004 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a6Q8VC69 545 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf12aQ9CR75 129 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnase1l2Q9D1G0 278 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem269Q9D4Y8 254 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdzk1Q9JIL4 519 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam25Q9R159 760 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SpegQ62407 3262 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam170bE9PXT9 378 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw9F8VPX2 458 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tuba1bP05213 451 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sbk2P0C5K1 362 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tuba1aP68369 451 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcna7Q17ST2 489 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VclQ64727 1066 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl19Q6PB97 674 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrlhrQ6VMN6 370 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glt28d2Q8BML3 165 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zhx3Q8C0Q2 951 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map2k7Q8CE90 535 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 As3mtQ91WU5 376 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col25a1Q99MQ5 666 aa12□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aadacl2B2RWD2 401 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il20rbE9Q9A6 308 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PdynO35417 248 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HpnO35453 436 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clk4O35493 481 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fabp3P11404 133 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atxn1P54254 791 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fkbp14P59024 211 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rack1P68040 317 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NrtnP97463 195 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp935Q14DI0 353 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3UST5 385 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmub2Q3V209 319 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dennd5aQ6PAL8 1287 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf513Q6PD29 541 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elmod2Q8BGF6 293 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csgalnact1Q8BJQ9 530 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LsampQ8BLK3 341 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Txnl4bQ8BUH1 149 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Banf2Q8BVR0 90 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx16Q8C080 344 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fndc5Q8K4Z2 209 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FevQ8QZW2 237 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ak6Q8VCP8 172 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1278Q8VF39 313 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpe65Q91ZQ5 533 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pnp2Q9D8C9 305 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acot2Q9QYR9 453 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VcanQ62059 3357 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H60cB1B213 197 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdzd8B9EJ80 1147 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dab1P97318 588 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prelid2Q0VBB0 177 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3USZ8 430 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klra2Q60660 288 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OclnQ61146 521 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1308Q7TQX0 320 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slco4c1Q8BGD4 722 aa11.99□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GanabQ8BHN3 944 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.2 ms