Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K1

Sbk2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk2P0C5K1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Sbk2P0C5K1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sbk2P0C5K1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sbk2P0C5K1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sbk2P0C5K1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Sbk2P0C5K1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Sbk2P0C5K1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Sbk2P0C5K1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Sbk2P0C5K1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sbk2P0C5K1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Sbk2P0C5K1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Sbk2P0C5K1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sbk2P0C5K1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Sbk2P0C5K1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sbk2P0C5K1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sbk2P0C5K1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sbk2P0C5K1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Sbk2P0C5K1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sbk2P0C5K1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sbk2P0C5K1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sbk2P0C5K1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sbk2P0C5K1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sbk2P0C5K1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sbk2P0C5K1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sbk2P0C5K1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sbk2P0C5K1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Sbk2P0C5K1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sbk2P0C5K1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sbk2P0C5K1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sbk2P0C5K1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sbk2P0C5K1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sbk2P0C5K1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sbk2P0C5K1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sbk2P0C5K1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sbk2P0C5K1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sbk2P0C5K1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sbk2P0C5K1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sbk2P0C5K1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sbk2P0C5K1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sbk2P0C5K1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sbk2P0C5K1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sbk2P0C5K1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sbk2P0C5K1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sbk2P0C5K1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sbk2P0C5K1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sbk2P0C5K1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Sbk2P0C5K1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sbk2P0C5K1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sbk2P0C5K1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sbk2P0C5K1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sbk2P0C5K1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sbk2P0C5K1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sbk2P0C5K1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sbk2P0C5K1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sbk2P0C5K1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sbk2P0C5K1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sbk2P0C5K1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sbk2P0C5K1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sbk2P0C5K1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sbk2P0C5K1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sbk2P0C5K1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sbk2P0C5K1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbk2P0C5K1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sbk2P0C5K1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sbk2P0C5K1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sbk2P0C5K1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sbk2P0C5K1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sbk2P0C5K1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sbk2P0C5K1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sbk2P0C5K1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sbk2P0C5K1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sbk2P0C5K1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Sbk2P0C5K1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sbk2P0C5K1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sbk2P0C5K1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sbk2P0C5K1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sbk2P0C5K1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sbk2P0C5K1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbk2P0C5K1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sbk2P0C5K1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sbk2P0C5K1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbk2P0C5K1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sbk2P0C5K1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbk2P0C5K1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sbk2P0C5K1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sbk2P0C5K1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sbk2P0C5K1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbk2P0C5K1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sbk2P0C5K1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sbk2P0C5K1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sbk2P0C5K1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sbk2P0C5K1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sbk2P0C5K1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sbk2P0C5K1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sbk2P0C5K1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sbk2P0C5K1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sbk2P0C5K1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sbk2P0C5K1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sbk2P0C5K1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sbk2P0C5K1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms