Protein–RNA interactions for Protein: O35417

Pdyn, Proenkephalin-B, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdynO35417 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PdynO35417 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PdynO35417 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PdynO35417 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PdynO35417 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PdynO35417 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PdynO35417 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PdynO35417 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PdynO35417 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PdynO35417 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PdynO35417 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PdynO35417 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PdynO35417 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PdynO35417 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PdynO35417 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PdynO35417 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PdynO35417 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PdynO35417 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PdynO35417 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PdynO35417 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PdynO35417 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PdynO35417 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PdynO35417 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PdynO35417 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PdynO35417 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PdynO35417 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PdynO35417 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PdynO35417 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PdynO35417 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PdynO35417 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PdynO35417 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PdynO35417 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PdynO35417 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PdynO35417 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PdynO35417 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PdynO35417 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PdynO35417 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PdynO35417 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PdynO35417 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PdynO35417 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PdynO35417 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PdynO35417 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PdynO35417 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PdynO35417 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PdynO35417 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PdynO35417 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PdynO35417 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PdynO35417 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PdynO35417 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PdynO35417 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PdynO35417 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PdynO35417 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PdynO35417 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PdynO35417 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PdynO35417 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PdynO35417 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PdynO35417 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PdynO35417 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PdynO35417 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PdynO35417 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PdynO35417 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PdynO35417 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PdynO35417 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PdynO35417 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PdynO35417 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PdynO35417 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PdynO35417 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PdynO35417 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PdynO35417 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PdynO35417 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PdynO35417 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PdynO35417 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PdynO35417 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PdynO35417 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PdynO35417 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PdynO35417 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PdynO35417 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PdynO35417 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PdynO35417 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PdynO35417 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PdynO35417 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PdynO35417 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PdynO35417 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PdynO35417 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PdynO35417 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PdynO35417 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PdynO35417 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PdynO35417 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PdynO35417 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PdynO35417 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PdynO35417 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PdynO35417 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PdynO35417 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PdynO35417 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PdynO35417 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PdynO35417 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PdynO35417 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PdynO35417 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PdynO35417 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PdynO35417 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms