Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUH1

Txnl4b, Thioredoxin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl4bQ8BUH1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,28■■■□□ 2,6
Txnl4bQ8BUH1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Txnl4bQ8BUH1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Txnl4bQ8BUH1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Txnl4bQ8BUH1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Txnl4bQ8BUH1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Txnl4bQ8BUH1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Txnl4bQ8BUH1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Txnl4bQ8BUH1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Txnl4bQ8BUH1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Txnl4bQ8BUH1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Txnl4bQ8BUH1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Txnl4bQ8BUH1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Txnl4bQ8BUH1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Txnl4bQ8BUH1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Txnl4bQ8BUH1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Txnl4bQ8BUH1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Txnl4bQ8BUH1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Txnl4bQ8BUH1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Txnl4bQ8BUH1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Txnl4bQ8BUH1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Txnl4bQ8BUH1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Txnl4bQ8BUH1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Txnl4bQ8BUH1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Txnl4bQ8BUH1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Txnl4bQ8BUH1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Txnl4bQ8BUH1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Txnl4bQ8BUH1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Txnl4bQ8BUH1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Txnl4bQ8BUH1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Txnl4bQ8BUH1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Txnl4bQ8BUH1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Txnl4bQ8BUH1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Txnl4bQ8BUH1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
Txnl4bQ8BUH1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Txnl4bQ8BUH1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Txnl4bQ8BUH1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Txnl4bQ8BUH1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Txnl4bQ8BUH1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Txnl4bQ8BUH1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Txnl4bQ8BUH1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Txnl4bQ8BUH1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Txnl4bQ8BUH1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Txnl4bQ8BUH1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Txnl4bQ8BUH1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Txnl4bQ8BUH1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Txnl4bQ8BUH1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Txnl4bQ8BUH1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Txnl4bQ8BUH1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Txnl4bQ8BUH1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Txnl4bQ8BUH1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Txnl4bQ8BUH1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Txnl4bQ8BUH1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Txnl4bQ8BUH1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Txnl4bQ8BUH1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Txnl4bQ8BUH1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Txnl4bQ8BUH1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Txnl4bQ8BUH1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Txnl4bQ8BUH1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,68
Txnl4bQ8BUH1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Txnl4bQ8BUH1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Txnl4bQ8BUH1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Txnl4bQ8BUH1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Txnl4bQ8BUH1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Txnl4bQ8BUH1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Txnl4bQ8BUH1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Txnl4bQ8BUH1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Txnl4bQ8BUH1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Txnl4bQ8BUH1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Txnl4bQ8BUH1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Txnl4bQ8BUH1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Txnl4bQ8BUH1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Txnl4bQ8BUH1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Txnl4bQ8BUH1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Txnl4bQ8BUH1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Txnl4bQ8BUH1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Txnl4bQ8BUH1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Txnl4bQ8BUH1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Txnl4bQ8BUH1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Txnl4bQ8BUH1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Txnl4bQ8BUH1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Txnl4bQ8BUH1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Txnl4bQ8BUH1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Txnl4bQ8BUH1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Txnl4bQ8BUH1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Txnl4bQ8BUH1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Txnl4bQ8BUH1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Txnl4bQ8BUH1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Txnl4bQ8BUH1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Txnl4bQ8BUH1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Txnl4bQ8BUH1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Txnl4bQ8BUH1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Txnl4bQ8BUH1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Txnl4bQ8BUH1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Txnl4bQ8BUH1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Txnl4bQ8BUH1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Txnl4bQ8BUH1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Txnl4bQ8BUH1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Txnl4bQ8BUH1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Txnl4bQ8BUH1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms