Protein–RNA interactions for Protein: Q3TW96

Uap1l1, UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uap1l1Q3TW96 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Uap1l1Q3TW96 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Uap1l1Q3TW96 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Uap1l1Q3TW96 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Uap1l1Q3TW96 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Uap1l1Q3TW96 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Uap1l1Q3TW96 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Uap1l1Q3TW96 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Uap1l1Q3TW96 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Uap1l1Q3TW96 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Uap1l1Q3TW96 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Uap1l1Q3TW96 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Uap1l1Q3TW96 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Uap1l1Q3TW96 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Uap1l1Q3TW96 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Uap1l1Q3TW96 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Uap1l1Q3TW96 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Uap1l1Q3TW96 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Uap1l1Q3TW96 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Uap1l1Q3TW96 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Uap1l1Q3TW96 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Uap1l1Q3TW96 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Uap1l1Q3TW96 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Uap1l1Q3TW96 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Uap1l1Q3TW96 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Uap1l1Q3TW96 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Uap1l1Q3TW96 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Uap1l1Q3TW96 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Uap1l1Q3TW96 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Uap1l1Q3TW96 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Uap1l1Q3TW96 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Uap1l1Q3TW96 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Uap1l1Q3TW96 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Uap1l1Q3TW96 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Uap1l1Q3TW96 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Uap1l1Q3TW96 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Uap1l1Q3TW96 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Uap1l1Q3TW96 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Uap1l1Q3TW96 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Uap1l1Q3TW96 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Uap1l1Q3TW96 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Uap1l1Q3TW96 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Uap1l1Q3TW96 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Uap1l1Q3TW96 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Uap1l1Q3TW96 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Uap1l1Q3TW96 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Uap1l1Q3TW96 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Uap1l1Q3TW96 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Uap1l1Q3TW96 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Uap1l1Q3TW96 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Uap1l1Q3TW96 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Uap1l1Q3TW96 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Uap1l1Q3TW96 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Uap1l1Q3TW96 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uap1l1Q3TW96 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Uap1l1Q3TW96 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Uap1l1Q3TW96 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Uap1l1Q3TW96 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uap1l1Q3TW96 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uap1l1Q3TW96 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Uap1l1Q3TW96 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Uap1l1Q3TW96 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Uap1l1Q3TW96 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Uap1l1Q3TW96 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uap1l1Q3TW96 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Uap1l1Q3TW96 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uap1l1Q3TW96 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Uap1l1Q3TW96 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Uap1l1Q3TW96 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uap1l1Q3TW96 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Uap1l1Q3TW96 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Uap1l1Q3TW96 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Uap1l1Q3TW96 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uap1l1Q3TW96 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Uap1l1Q3TW96 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Uap1l1Q3TW96 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uap1l1Q3TW96 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Uap1l1Q3TW96 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Uap1l1Q3TW96 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Uap1l1Q3TW96 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Uap1l1Q3TW96 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uap1l1Q3TW96 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uap1l1Q3TW96 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uap1l1Q3TW96 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Uap1l1Q3TW96 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Uap1l1Q3TW96 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uap1l1Q3TW96 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uap1l1Q3TW96 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Uap1l1Q3TW96 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uap1l1Q3TW96 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uap1l1Q3TW96 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uap1l1Q3TW96 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Uap1l1Q3TW96 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uap1l1Q3TW96 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Uap1l1Q3TW96 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Uap1l1Q3TW96 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uap1l1Q3TW96 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uap1l1Q3TW96 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uap1l1Q3TW96 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uap1l1Q3TW96 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms