Protein–RNA interactions for Protein: O70578

Cacng1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng1O70578 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Cacng1O70578 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Cacng1O70578 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Cacng1O70578 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Cacng1O70578 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Cacng1O70578 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Cacng1O70578 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Cacng1O70578 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Cacng1O70578 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Cacng1O70578 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Cacng1O70578 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cacng1O70578 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cacng1O70578 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Cacng1O70578 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,42■■■□□ 2,3
Cacng1O70578 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Cacng1O70578 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Cacng1O70578 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Cacng1O70578 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Cacng1O70578 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Cacng1O70578 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cacng1O70578 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cacng1O70578 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Cacng1O70578 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Cacng1O70578 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Cacng1O70578 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Cacng1O70578 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Cacng1O70578 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,58■■■□□ 2,16
Cacng1O70578 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Cacng1O70578 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Cacng1O70578 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Cacng1O70578 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cacng1O70578 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cacng1O70578 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cacng1O70578 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cacng1O70578 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Cacng1O70578 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Cacng1O70578 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cacng1O70578 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cacng1O70578 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Cacng1O70578 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cacng1O70578 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,05
Cacng1O70578 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Cacng1O70578 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Cacng1O70578 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Cacng1O70578 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Cacng1O70578 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Cacng1O70578 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Cacng1O70578 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Cacng1O70578 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,51■■□□□ 1,99
Cacng1O70578 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cacng1O70578 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Cacng1O70578 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cacng1O70578 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cacng1O70578 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Cacng1O70578 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cacng1O70578 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Cacng1O70578 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cacng1O70578 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Cacng1O70578 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cacng1O70578 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Cacng1O70578 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Cacng1O70578 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Cacng1O70578 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Cacng1O70578 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Cacng1O70578 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Cacng1O70578 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Cacng1O70578 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Cacng1O70578 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Cacng1O70578 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Cacng1O70578 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Cacng1O70578 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Cacng1O70578 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Cacng1O70578 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Cacng1O70578 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Cacng1O70578 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Cacng1O70578 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Cacng1O70578 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Cacng1O70578 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Cacng1O70578 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Cacng1O70578 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Cacng1O70578 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Cacng1O70578 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Cacng1O70578 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Cacng1O70578 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Cacng1O70578 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Cacng1O70578 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Cacng1O70578 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Cacng1O70578 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Cacng1O70578 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Cacng1O70578 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Cacng1O70578 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Cacng1O70578 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Cacng1O70578 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Cacng1O70578 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Cacng1O70578 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Cacng1O70578 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Cacng1O70578 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Cacng1O70578 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Cacng1O70578 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Cacng1O70578 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms