Protein–RNA interactions for Protein: O70578

Cacng1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng1O70578 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Cacng1O70578 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cacng1O70578 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cacng1O70578 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cacng1O70578 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Cacng1O70578 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cacng1O70578 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cacng1O70578 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cacng1O70578 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Cacng1O70578 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cacng1O70578 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacng1O70578 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacng1O70578 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cacng1O70578 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacng1O70578 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cacng1O70578 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cacng1O70578 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cacng1O70578 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cacng1O70578 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cacng1O70578 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cacng1O70578 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cacng1O70578 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacng1O70578 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacng1O70578 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacng1O70578 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacng1O70578 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacng1O70578 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Cacng1O70578 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacng1O70578 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacng1O70578 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cacng1O70578 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacng1O70578 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cacng1O70578 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cacng1O70578 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cacng1O70578 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cacng1O70578 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cacng1O70578 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacng1O70578 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacng1O70578 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cacng1O70578 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cacng1O70578 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cacng1O70578 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cacng1O70578 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cacng1O70578 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cacng1O70578 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cacng1O70578 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cacng1O70578 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cacng1O70578 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cacng1O70578 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cacng1O70578 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacng1O70578 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cacng1O70578 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacng1O70578 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacng1O70578 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacng1O70578 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacng1O70578 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacng1O70578 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacng1O70578 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacng1O70578 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacng1O70578 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacng1O70578 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacng1O70578 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacng1O70578 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cacng1O70578 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacng1O70578 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacng1O70578 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cacng1O70578 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cacng1O70578 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacng1O70578 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacng1O70578 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cacng1O70578 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacng1O70578 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cacng1O70578 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cacng1O70578 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacng1O70578 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacng1O70578 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacng1O70578 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacng1O70578 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacng1O70578 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacng1O70578 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacng1O70578 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacng1O70578 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacng1O70578 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacng1O70578 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacng1O70578 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacng1O70578 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacng1O70578 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacng1O70578 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacng1O70578 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacng1O70578 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacng1O70578 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacng1O70578 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacng1O70578 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacng1O70578 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cacng1O70578 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cacng1O70578 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cacng1O70578 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cacng1O70578 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacng1O70578 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacng1O70578 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms