Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ap3m1Q9JKC8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ap3m1Q9JKC8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ap3m1Q9JKC8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ap3m1Q9JKC8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ap3m1Q9JKC8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ap3m1Q9JKC8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ap3m1Q9JKC8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ap3m1Q9JKC8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ap3m1Q9JKC8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ap3m1Q9JKC8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3m1Q9JKC8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ap3m1Q9JKC8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3m1Q9JKC8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3m1Q9JKC8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ap3m1Q9JKC8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ap3m1Q9JKC8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap3m1Q9JKC8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Ap3m1Q9JKC8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ap3m1Q9JKC8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ap3m1Q9JKC8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ap3m1Q9JKC8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ap3m1Q9JKC8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3m1Q9JKC8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3m1Q9JKC8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3m1Q9JKC8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3m1Q9JKC8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3m1Q9JKC8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ap3m1Q9JKC8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3m1Q9JKC8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3m1Q9JKC8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3m1Q9JKC8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ap3m1Q9JKC8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ap3m1Q9JKC8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3m1Q9JKC8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ap3m1Q9JKC8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3m1Q9JKC8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ap3m1Q9JKC8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ap3m1Q9JKC8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap3m1Q9JKC8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ap3m1Q9JKC8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3m1Q9JKC8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3m1Q9JKC8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3m1Q9JKC8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3m1Q9JKC8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3m1Q9JKC8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ap3m1Q9JKC8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ap3m1Q9JKC8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3m1Q9JKC8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3m1Q9JKC8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ap3m1Q9JKC8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ap3m1Q9JKC8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3m1Q9JKC8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ap3m1Q9JKC8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ap3m1Q9JKC8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ap3m1Q9JKC8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3m1Q9JKC8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ap3m1Q9JKC8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ap3m1Q9JKC8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ap3m1Q9JKC8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3m1Q9JKC8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3m1Q9JKC8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap3m1Q9JKC8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3m1Q9JKC8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3m1Q9JKC8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ap3m1Q9JKC8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ap3m1Q9JKC8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ap3m1Q9JKC8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ap3m1Q9JKC8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3m1Q9JKC8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3m1Q9JKC8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ap3m1Q9JKC8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ap3m1Q9JKC8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3m1Q9JKC8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3m1Q9JKC8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ap3m1Q9JKC8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ap3m1Q9JKC8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ap3m1Q9JKC8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ap3m1Q9JKC8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ap3m1Q9JKC8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3m1Q9JKC8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ap3m1Q9JKC8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ap3m1Q9JKC8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ap3m1Q9JKC8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3m1Q9JKC8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3m1Q9JKC8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3m1Q9JKC8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ap3m1Q9JKC8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ap3m1Q9JKC8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ap3m1Q9JKC8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ap3m1Q9JKC8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ap3m1Q9JKC8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms