Protein–RNA interactions for Protein: P11404

Fabp3, Fatty acid-binding protein, heart, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fabp3P11404 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fabp3P11404 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Fabp3P11404 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fabp3P11404 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fabp3P11404 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Fabp3P11404 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Fabp3P11404 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fabp3P11404 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fabp3P11404 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fabp3P11404 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fabp3P11404 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fabp3P11404 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fabp3P11404 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fabp3P11404 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fabp3P11404 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fabp3P11404 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fabp3P11404 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fabp3P11404 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Fabp3P11404 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fabp3P11404 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fabp3P11404 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fabp3P11404 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fabp3P11404 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fabp3P11404 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Fabp3P11404 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Fabp3P11404 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fabp3P11404 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fabp3P11404 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fabp3P11404 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fabp3P11404 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Fabp3P11404 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fabp3P11404 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fabp3P11404 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fabp3P11404 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fabp3P11404 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fabp3P11404 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fabp3P11404 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Fabp3P11404 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fabp3P11404 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fabp3P11404 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fabp3P11404 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fabp3P11404 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fabp3P11404 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fabp3P11404 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Fabp3P11404 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fabp3P11404 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fabp3P11404 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fabp3P11404 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fabp3P11404 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fabp3P11404 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fabp3P11404 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fabp3P11404 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fabp3P11404 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Fabp3P11404 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fabp3P11404 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fabp3P11404 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fabp3P11404 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fabp3P11404 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fabp3P11404 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fabp3P11404 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fabp3P11404 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fabp3P11404 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fabp3P11404 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fabp3P11404 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fabp3P11404 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fabp3P11404 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Fabp3P11404 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fabp3P11404 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fabp3P11404 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fabp3P11404 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fabp3P11404 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fabp3P11404 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fabp3P11404 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Fabp3P11404 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fabp3P11404 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fabp3P11404 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fabp3P11404 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fabp3P11404 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fabp3P11404 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fabp3P11404 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fabp3P11404 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fabp3P11404 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fabp3P11404 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fabp3P11404 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fabp3P11404 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fabp3P11404 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fabp3P11404 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fabp3P11404 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fabp3P11404 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fabp3P11404 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fabp3P11404 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fabp3P11404 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fabp3P11404 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fabp3P11404 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fabp3P11404 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fabp3P11404 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fabp3P11404 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fabp3P11404 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fabp3P11404 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fabp3P11404 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms