Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ9

Csgalnact1, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Csgalnact1Q8BJQ9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Csgalnact1Q8BJQ9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Csgalnact1Q8BJQ9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Csgalnact1Q8BJQ9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Csgalnact1Q8BJQ9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Csgalnact1Q8BJQ9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Csgalnact1Q8BJQ9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Csgalnact1Q8BJQ9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Csgalnact1Q8BJQ9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Csgalnact1Q8BJQ9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Csgalnact1Q8BJQ9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Csgalnact1Q8BJQ9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Csgalnact1Q8BJQ9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Csgalnact1Q8BJQ9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Csgalnact1Q8BJQ9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Csgalnact1Q8BJQ9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Csgalnact1Q8BJQ9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Csgalnact1Q8BJQ9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Csgalnact1Q8BJQ9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Csgalnact1Q8BJQ9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Csgalnact1Q8BJQ9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Csgalnact1Q8BJQ9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Csgalnact1Q8BJQ9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Csgalnact1Q8BJQ9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Csgalnact1Q8BJQ9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Csgalnact1Q8BJQ9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Csgalnact1Q8BJQ9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Csgalnact1Q8BJQ9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csgalnact1Q8BJQ9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csgalnact1Q8BJQ9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csgalnact1Q8BJQ9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Csgalnact1Q8BJQ9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csgalnact1Q8BJQ9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csgalnact1Q8BJQ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Csgalnact1Q8BJQ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Csgalnact1Q8BJQ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csgalnact1Q8BJQ9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Csgalnact1Q8BJQ9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Csgalnact1Q8BJQ9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Csgalnact1Q8BJQ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Csgalnact1Q8BJQ9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Csgalnact1Q8BJQ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Csgalnact1Q8BJQ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Csgalnact1Q8BJQ9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csgalnact1Q8BJQ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csgalnact1Q8BJQ9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Csgalnact1Q8BJQ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Csgalnact1Q8BJQ9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csgalnact1Q8BJQ9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Csgalnact1Q8BJQ9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Csgalnact1Q8BJQ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csgalnact1Q8BJQ9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Csgalnact1Q8BJQ9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Csgalnact1Q8BJQ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Csgalnact1Q8BJQ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Csgalnact1Q8BJQ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Csgalnact1Q8BJQ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Csgalnact1Q8BJQ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Csgalnact1Q8BJQ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Csgalnact1Q8BJQ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Csgalnact1Q8BJQ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Csgalnact1Q8BJQ9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Csgalnact1Q8BJQ9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Csgalnact1Q8BJQ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Csgalnact1Q8BJQ9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Csgalnact1Q8BJQ9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Csgalnact1Q8BJQ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Csgalnact1Q8BJQ9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Csgalnact1Q8BJQ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csgalnact1Q8BJQ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Csgalnact1Q8BJQ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Csgalnact1Q8BJQ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Csgalnact1Q8BJQ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Csgalnact1Q8BJQ9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csgalnact1Q8BJQ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Csgalnact1Q8BJQ9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Csgalnact1Q8BJQ9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Csgalnact1Q8BJQ9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
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