Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL4

Pdzk1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1Q9JIL4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,16■■■■□ 3,06
Pdzk1Q9JIL4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Pdzk1Q9JIL4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Pdzk1Q9JIL4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Pdzk1Q9JIL4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Pdzk1Q9JIL4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Pdzk1Q9JIL4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Pdzk1Q9JIL4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Pdzk1Q9JIL4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Pdzk1Q9JIL4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Pdzk1Q9JIL4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Pdzk1Q9JIL4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Pdzk1Q9JIL4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Pdzk1Q9JIL4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Pdzk1Q9JIL4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Pdzk1Q9JIL4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,7■■■□□ 2,19
Pdzk1Q9JIL4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Pdzk1Q9JIL4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Pdzk1Q9JIL4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Pdzk1Q9JIL4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Pdzk1Q9JIL4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Pdzk1Q9JIL4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Pdzk1Q9JIL4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Pdzk1Q9JIL4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Pdzk1Q9JIL4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Pdzk1Q9JIL4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Pdzk1Q9JIL4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pdzk1Q9JIL4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Pdzk1Q9JIL4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,95■■■□□ 2,07
Pdzk1Q9JIL4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Pdzk1Q9JIL4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Pdzk1Q9JIL4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Pdzk1Q9JIL4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Pdzk1Q9JIL4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Pdzk1Q9JIL4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Pdzk1Q9JIL4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Pdzk1Q9JIL4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Pdzk1Q9JIL4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Pdzk1Q9JIL4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Pdzk1Q9JIL4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Pdzk1Q9JIL4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Pdzk1Q9JIL4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Pdzk1Q9JIL4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Pdzk1Q9JIL4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Pdzk1Q9JIL4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pdzk1Q9JIL4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Pdzk1Q9JIL4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Pdzk1Q9JIL4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Pdzk1Q9JIL4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Pdzk1Q9JIL4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Pdzk1Q9JIL4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Pdzk1Q9JIL4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Pdzk1Q9JIL4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Pdzk1Q9JIL4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pdzk1Q9JIL4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Pdzk1Q9JIL4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Pdzk1Q9JIL4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,76■■□□□ 1,88
Pdzk1Q9JIL4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Pdzk1Q9JIL4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Pdzk1Q9JIL4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Pdzk1Q9JIL4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Pdzk1Q9JIL4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Pdzk1Q9JIL4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Pdzk1Q9JIL4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Pdzk1Q9JIL4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Pdzk1Q9JIL4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Pdzk1Q9JIL4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
Pdzk1Q9JIL4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Pdzk1Q9JIL4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Pdzk1Q9JIL4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Pdzk1Q9JIL4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Pdzk1Q9JIL4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Pdzk1Q9JIL4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Pdzk1Q9JIL4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Pdzk1Q9JIL4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Pdzk1Q9JIL4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Pdzk1Q9JIL4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Pdzk1Q9JIL4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Pdzk1Q9JIL4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Pdzk1Q9JIL4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Pdzk1Q9JIL4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Pdzk1Q9JIL4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Pdzk1Q9JIL4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Pdzk1Q9JIL4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Pdzk1Q9JIL4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Pdzk1Q9JIL4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Pdzk1Q9JIL4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Pdzk1Q9JIL4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Pdzk1Q9JIL4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Pdzk1Q9JIL4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Pdzk1Q9JIL4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Pdzk1Q9JIL4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Pdzk1Q9JIL4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Pdzk1Q9JIL4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Pdzk1Q9JIL4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Pdzk1Q9JIL4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Pdzk1Q9JIL4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Pdzk1Q9JIL4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Pdzk1Q9JIL4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Pdzk1Q9JIL4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
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