Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Ddx52Q8K301 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ddx52Q8K301 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ddx52Q8K301 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ddx52Q8K301 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ddx52Q8K301 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ddx52Q8K301 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ddx52Q8K301 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ddx52Q8K301 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Ddx52Q8K301 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ddx52Q8K301 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ddx52Q8K301 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Ddx52Q8K301 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ddx52Q8K301 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ddx52Q8K301 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ddx52Q8K301 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ddx52Q8K301 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ddx52Q8K301 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ddx52Q8K301 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ddx52Q8K301 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddx52Q8K301 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ddx52Q8K301 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ddx52Q8K301 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ddx52Q8K301 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ddx52Q8K301 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ddx52Q8K301 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ddx52Q8K301 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ddx52Q8K301 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ddx52Q8K301 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ddx52Q8K301 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ddx52Q8K301 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ddx52Q8K301 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddx52Q8K301 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ddx52Q8K301 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ddx52Q8K301 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ddx52Q8K301 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ddx52Q8K301 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx52Q8K301 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddx52Q8K301 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddx52Q8K301 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddx52Q8K301 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddx52Q8K301 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ddx52Q8K301 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx52Q8K301 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx52Q8K301 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx52Q8K301 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx52Q8K301 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ddx52Q8K301 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddx52Q8K301 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddx52Q8K301 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx52Q8K301 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx52Q8K301 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx52Q8K301 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx52Q8K301 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx52Q8K301 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx52Q8K301 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddx52Q8K301 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx52Q8K301 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx52Q8K301 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ddx52Q8K301 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx52Q8K301 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ddx52Q8K301 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ddx52Q8K301 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx52Q8K301 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ddx52Q8K301 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx52Q8K301 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ddx52Q8K301 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx52Q8K301 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ddx52Q8K301 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx52Q8K301 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx52Q8K301 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx52Q8K301 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ddx52Q8K301 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx52Q8K301 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx52Q8K301 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx52Q8K301 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx52Q8K301 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx52Q8K301 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ddx52Q8K301 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx52Q8K301 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx52Q8K301 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddx52Q8K301 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx52Q8K301 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddx52Q8K301 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddx52Q8K301 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddx52Q8K301 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx52Q8K301 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx52Q8K301 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx52Q8K301 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddx52Q8K301 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddx52Q8K301 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddx52Q8K301 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ddx52Q8K301 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ddx52Q8K301 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ddx52Q8K301 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx52Q8K301 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ddx52Q8K301 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ddx52Q8K301 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ddx52Q8K301 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ddx52Q8K301 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms