Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

Deleted in autism protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Q3USZ8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Q3USZ8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Q3USZ8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Q3USZ8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Q3USZ8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Q3USZ8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Q3USZ8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Q3USZ8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Q3USZ8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Q3USZ8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Q3USZ8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Q3USZ8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Q3USZ8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Q3USZ8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Q3USZ8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Q3USZ8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Q3USZ8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Q3USZ8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Q3USZ8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Q3USZ8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Q3USZ8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Q3USZ8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Q3USZ8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Q3USZ8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Q3USZ8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Q3USZ8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Q3USZ8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Q3USZ8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Q3USZ8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q3USZ8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q3USZ8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Q3USZ8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q3USZ8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Q3USZ8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3USZ8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3USZ8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3USZ8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q3USZ8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Q3USZ8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Q3USZ8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q3USZ8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3USZ8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3USZ8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3USZ8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q3USZ8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3USZ8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3USZ8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3USZ8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3USZ8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3USZ8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3USZ8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3USZ8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3USZ8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Q3USZ8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Q3USZ8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Q3USZ8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3USZ8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3USZ8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3USZ8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3USZ8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3USZ8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3USZ8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3USZ8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3USZ8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3USZ8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Q3USZ8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3USZ8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q3USZ8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3USZ8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q3USZ8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q3USZ8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q3USZ8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q3USZ8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q3USZ8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Q3USZ8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Q3USZ8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Q3USZ8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q3USZ8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q3USZ8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Q3USZ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Q3USZ8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q3USZ8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q3USZ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3USZ8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3USZ8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3USZ8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3USZ8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3USZ8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q3USZ8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3USZ8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Q3USZ8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Q3USZ8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3USZ8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3USZ8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3USZ8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3USZ8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3USZ8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3USZ8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3USZ8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms