Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMN6

Prlhr, Prolactin-releasing peptide receptor, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlhrQ6VMN6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
PrlhrQ6VMN6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
PrlhrQ6VMN6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
PrlhrQ6VMN6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
PrlhrQ6VMN6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
PrlhrQ6VMN6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,82■■■□□ 2,68
PrlhrQ6VMN6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,76■■■□□ 2,67
PrlhrQ6VMN6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,18■■■□□ 2,58
PrlhrQ6VMN6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,01■■■□□ 2,55
PrlhrQ6VMN6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
PrlhrQ6VMN6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
PrlhrQ6VMN6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
PrlhrQ6VMN6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
PrlhrQ6VMN6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
PrlhrQ6VMN6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
PrlhrQ6VMN6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
PrlhrQ6VMN6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
PrlhrQ6VMN6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
PrlhrQ6VMN6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
PrlhrQ6VMN6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
PrlhrQ6VMN6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
PrlhrQ6VMN6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
PrlhrQ6VMN6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
PrlhrQ6VMN6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
PrlhrQ6VMN6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
PrlhrQ6VMN6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
PrlhrQ6VMN6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
PrlhrQ6VMN6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
PrlhrQ6VMN6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
PrlhrQ6VMN6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,29■■■□□ 2,28
PrlhrQ6VMN6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
PrlhrQ6VMN6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
PrlhrQ6VMN6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
PrlhrQ6VMN6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
PrlhrQ6VMN6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
PrlhrQ6VMN6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
PrlhrQ6VMN6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
PrlhrQ6VMN6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,66■■■□□ 2,18
PrlhrQ6VMN6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
PrlhrQ6VMN6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
PrlhrQ6VMN6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
PrlhrQ6VMN6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
PrlhrQ6VMN6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
PrlhrQ6VMN6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
PrlhrQ6VMN6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
PrlhrQ6VMN6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
PrlhrQ6VMN6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
PrlhrQ6VMN6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
PrlhrQ6VMN6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
PrlhrQ6VMN6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
PrlhrQ6VMN6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
PrlhrQ6VMN6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
PrlhrQ6VMN6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
PrlhrQ6VMN6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
PrlhrQ6VMN6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
PrlhrQ6VMN6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
PrlhrQ6VMN6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
PrlhrQ6VMN6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
PrlhrQ6VMN6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
PrlhrQ6VMN6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
PrlhrQ6VMN6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,85■■■□□ 2,05
PrlhrQ6VMN6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
PrlhrQ6VMN6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
PrlhrQ6VMN6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,78■■■□□ 2,04
PrlhrQ6VMN6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
PrlhrQ6VMN6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,72■■■□□ 2,03
PrlhrQ6VMN6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
PrlhrQ6VMN6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
PrlhrQ6VMN6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
PrlhrQ6VMN6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
PrlhrQ6VMN6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
PrlhrQ6VMN6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
PrlhrQ6VMN6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,57■■■□□ 2
PrlhrQ6VMN6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
PrlhrQ6VMN6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
PrlhrQ6VMN6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
PrlhrQ6VMN6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,49■■□□□ 1,99
PrlhrQ6VMN6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
PrlhrQ6VMN6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
PrlhrQ6VMN6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
PrlhrQ6VMN6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
PrlhrQ6VMN6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,27■■□□□ 1,96
PrlhrQ6VMN6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
PrlhrQ6VMN6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
PrlhrQ6VMN6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
PrlhrQ6VMN6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
PrlhrQ6VMN6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
PrlhrQ6VMN6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
PrlhrQ6VMN6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
PrlhrQ6VMN6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
PrlhrQ6VMN6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
PrlhrQ6VMN6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
PrlhrQ6VMN6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
PrlhrQ6VMN6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
PrlhrQ6VMN6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
PrlhrQ6VMN6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
PrlhrQ6VMN6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
PrlhrQ6VMN6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
PrlhrQ6VMN6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
PrlhrQ6VMN6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,9 ms