Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Tgfb3P17125 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Tgfb3P17125 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Tgfb3P17125 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Tgfb3P17125 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Tgfb3P17125 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tgfb3P17125 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Tgfb3P17125 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Tgfb3P17125 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Tgfb3P17125 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tgfb3P17125 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tgfb3P17125 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tgfb3P17125 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tgfb3P17125 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Tgfb3P17125 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tgfb3P17125 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Tgfb3P17125 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Tgfb3P17125 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tgfb3P17125 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tgfb3P17125 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tgfb3P17125 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tgfb3P17125 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tgfb3P17125 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tgfb3P17125 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tgfb3P17125 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tgfb3P17125 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tgfb3P17125 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Tgfb3P17125 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Tgfb3P17125 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tgfb3P17125 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tgfb3P17125 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tgfb3P17125 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tgfb3P17125 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tgfb3P17125 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tgfb3P17125 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tgfb3P17125 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tgfb3P17125 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tgfb3P17125 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tgfb3P17125 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tgfb3P17125 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Tgfb3P17125 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Tgfb3P17125 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tgfb3P17125 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tgfb3P17125 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Tgfb3P17125 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tgfb3P17125 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tgfb3P17125 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tgfb3P17125 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tgfb3P17125 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tgfb3P17125 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tgfb3P17125 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tgfb3P17125 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tgfb3P17125 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tgfb3P17125 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tgfb3P17125 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tgfb3P17125 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tgfb3P17125 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tgfb3P17125 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tgfb3P17125 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tgfb3P17125 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tgfb3P17125 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tgfb3P17125 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tgfb3P17125 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tgfb3P17125 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tgfb3P17125 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tgfb3P17125 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tgfb3P17125 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tgfb3P17125 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tgfb3P17125 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tgfb3P17125 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tgfb3P17125 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Tgfb3P17125 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tgfb3P17125 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tgfb3P17125 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfb3P17125 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tgfb3P17125 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tgfb3P17125 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tgfb3P17125 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tgfb3P17125 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tgfb3P17125 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb3P17125 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tgfb3P17125 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Tgfb3P17125 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tgfb3P17125 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tgfb3P17125 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tgfb3P17125 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb3P17125 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tgfb3P17125 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tgfb3P17125 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tgfb3P17125 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tgfb3P17125 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tgfb3P17125 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfb3P17125 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tgfb3P17125 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb3P17125 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgfb3P17125 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgfb3P17125 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgfb3P17125 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Tgfb3P17125 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tgfb3P17125 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms