Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR9

Acot2, Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot2Q9QYR9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Acot2Q9QYR9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Acot2Q9QYR9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Acot2Q9QYR9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Acot2Q9QYR9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Acot2Q9QYR9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Acot2Q9QYR9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Acot2Q9QYR9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Acot2Q9QYR9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Acot2Q9QYR9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Acot2Q9QYR9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Acot2Q9QYR9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Acot2Q9QYR9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Acot2Q9QYR9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Acot2Q9QYR9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Acot2Q9QYR9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Acot2Q9QYR9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Acot2Q9QYR9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Acot2Q9QYR9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Acot2Q9QYR9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Acot2Q9QYR9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Acot2Q9QYR9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Acot2Q9QYR9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Acot2Q9QYR9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Acot2Q9QYR9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Acot2Q9QYR9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Acot2Q9QYR9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Acot2Q9QYR9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Acot2Q9QYR9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Acot2Q9QYR9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Acot2Q9QYR9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Acot2Q9QYR9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Acot2Q9QYR9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Acot2Q9QYR9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Acot2Q9QYR9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Acot2Q9QYR9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Acot2Q9QYR9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Acot2Q9QYR9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Acot2Q9QYR9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Acot2Q9QYR9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Acot2Q9QYR9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Acot2Q9QYR9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Acot2Q9QYR9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Acot2Q9QYR9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Acot2Q9QYR9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Acot2Q9QYR9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Acot2Q9QYR9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Acot2Q9QYR9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Acot2Q9QYR9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Acot2Q9QYR9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Acot2Q9QYR9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Acot2Q9QYR9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Acot2Q9QYR9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Acot2Q9QYR9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Acot2Q9QYR9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Acot2Q9QYR9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Acot2Q9QYR9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Acot2Q9QYR9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Acot2Q9QYR9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Acot2Q9QYR9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Acot2Q9QYR9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Acot2Q9QYR9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Acot2Q9QYR9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Acot2Q9QYR9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Acot2Q9QYR9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Acot2Q9QYR9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Acot2Q9QYR9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Acot2Q9QYR9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Acot2Q9QYR9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Acot2Q9QYR9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Acot2Q9QYR9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Acot2Q9QYR9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Acot2Q9QYR9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Acot2Q9QYR9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Acot2Q9QYR9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Acot2Q9QYR9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Acot2Q9QYR9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Acot2Q9QYR9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Acot2Q9QYR9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Acot2Q9QYR9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Acot2Q9QYR9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Acot2Q9QYR9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Acot2Q9QYR9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Acot2Q9QYR9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Acot2Q9QYR9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Acot2Q9QYR9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Acot2Q9QYR9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Acot2Q9QYR9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Acot2Q9QYR9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Acot2Q9QYR9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Acot2Q9QYR9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Acot2Q9QYR9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Acot2Q9QYR9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Acot2Q9QYR9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Acot2Q9QYR9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Acot2Q9QYR9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Acot2Q9QYR9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Acot2Q9QYR9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Acot2Q9QYR9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Acot2Q9QYR9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms