RNA–Protein interactions for RNA: YOR329C

SCD5, Transcript of Protein required for normal actin organization and endocytosis, yeast

Gene SCD5, Length 2,619 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCD5	YOR329C	HMI1	Q12039	706 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.56	□□□□□ -2	not detected
SCD5	YOR329C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	MRC1	P25588	1096 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	DPB3	P27344	201 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	CDC15	P27636	974 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	TGL1	P34163	548 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	PXL1	P36166	706 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YNR014W	P53719	212 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	HDA1	P53973	706 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YLR287C	Q05881	355 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	CIR2	Q08822	631 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	DAS2	Q12084	232 aa		2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	CLN3	P13365	580 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	CKI1	P20485	582 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	MCM2	P29469	868 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	CNS1	P33313	385 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	KTR2	P33550	425 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	BYE1	P36106	594 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	TVP38	P36164	337 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	LDH1	P38139	375 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	ERG7	P38604	731 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	SIP3	P38717	1229 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	SPC72	P39723	622 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	PSY2	P40164	858 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	PSF2	P40359	213 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	FIS1	P40515	155 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	MGA2	P40578	1113 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.55	□□□□□ -2	not detected
SCD5	YOR329C	YGR130C	P53278	816 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	ESBP6	P53918	673 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	GIS4	Q04233	774 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YPR078C	Q06813	372 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YPL277C	Q08989	487 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	HIF1	Q12373	385 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	PDR1	P12383	1068 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	SNA3	P14359	133 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	MSH3	P25336	1018 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	DPH2	P32461	534 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	COT1	P32798	439 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	RGT1	P32862	1170 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	ATG19	P35193	415 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	DCW1	P36091	449 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	HUL4	P40985	892 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	CIT3	P43635	486 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YGR237C	P50089	785 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	ORC4	P54791	529 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	RNT1	Q02555	471 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	EEB1	Q02891	456 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YPL034W	Q03083	165 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YDL073W	Q07454	984 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	TLG2	Q08144	397 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	OSW2	Q12202	724 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	QCR6	P00127	147 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YLR464W	P0CX17	216 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	HXT1	P32465	570 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YSC83	P32792	385 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	TFC4	P33339	1025 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	STS1	P38637	319 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	VPS29	P38759	282 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YEL076C	P39971	216 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	YEL025C	P39991	1188 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	VFA1	P40080	203 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	NDC80	P40460	691 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	MAD1	P40957	749 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	PXA1	P41909	870 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	ISM1	P48526	1002 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	VPS62	P53285	467 aa		2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SCD5	YOR329C	ERG5	P54781	538 aa		2.55	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.6 ms