RNA–Protein interactions for RNA: YMR219W

ESC1, Transcript of Protein localized to the nuclear periphery, yeast

Gene ESC1, Length 4,977 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESC1	YMR219W	TRS85	P46944	698 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	FMS1	P50264	508 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	UFD2	P54860	961 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	FMP30	Q02883	468 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	IVY1	Q04934	453 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ATG17	Q06410	417 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	REP1	P03871	373 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	SRL3	P36167	246 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	KTR4	P38131	464 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PIH1	P38768	344 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
ESC1	YMR219W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	DIP5	P53388	608 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ADY3	Q07732	790 aa		2.77	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	CKI1	P20485	582 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	CBP3	P21560	335 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	DPB3	P27344	201 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	NTH2	P35172	780 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YBR242W	P38331	238 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	GCD10	P41814	478 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	HOP2	P53187	214 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	MAL13	P53338	473 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	APP1	P53933	587 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	TGL2	P54857	326 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PMT7	Q06644	662 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PET122	P10355	254 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	SIT4	P20604	311 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ITR2	P30606	609 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	STE5	P32917	917 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	RTS1	P38903	757 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	FTR1	P40088	404 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	STB1	P42845	420 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	TOM22	P49334	152 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	GNT1	Q12096	491 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	OSH2	Q12451	1283 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PCK1	P10963	549 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	STE11	P23561	717 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	BLI1	P35727	113 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	FZO1	P38297	855 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YHR218W	P38899	603 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	CNN1	P43618	361 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	LIF1	P53150	421 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	MPS2	P53159	387 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YKR005C	Q02203	525 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	FIN1	Q03898	291 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	DPL1	Q05567	589 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ATG23	Q06671	453 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
ESC1	YMR219W	RAD1	P06777	1100 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ADH4	P10127	382 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
ESC1	YMR219W	PEP3	P27801	918 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	CNS1	P33313	385 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YKL100C	P34248	587 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	MUM2	P38236	366 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	RRM3	P38766	723 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PEX18	P38855	283 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YGR266W	P53326	701 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	RCM1	P53972	490 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	EAR1	Q03212	550 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	SYO1	Q07395	620 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	TGL5	Q12043	749 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ATE1	P16639	503 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	IRC8	P47046	822 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	ARH1	P48360	493 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	SPO1	P53541	631 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	IPI3	P53877	555 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	EFM6	P53970	246 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	BDF2	Q07442	638 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YIG1	Q08956	461 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	YPL260W	Q08977	551 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ESC1	YMR219W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97

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