RNA–Protein interactions for RNA: YMR066W

SOV1, Transcript of Mitochondrial protein of unknown function, yeast

Gene SOV1, Length 2,697 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOV1	YMR066W	PET112	P33893	541 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YKR075C	P36155	307 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MOH1	P38191	138 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TDP1	P38319	544 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YIL092W	P40497	633 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MND2	P40577	368 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YFL052W	P43551	465 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YDR514C	Q04408	483 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RKM4	Q12504	494 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SPE1	P08432	466 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CIT2	P08679	460 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	INO1	P11986	533 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NUP1	P20676	1076 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RAD53	P22216	821 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	LYP1	P32487	611 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TMT1	P32643	299 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	EXO5	P38289	585 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YHL050C	P38721	697 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RIM4	P38741	713 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ERP5	P38819	212 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YHR219W	P38900	624 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	XBP1	P40489	647 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YIR042C	P40586	236 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	FKH2	P41813	862 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MET12	P46151	657 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	STB2	P46679	850 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NET1	P47035	1189 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YGL140C	P53120	1219 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	IMO32	P53219	342 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SPC98	P53540	846 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YNL058C	P53947	316 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.42	□□□□□ -2.34	not detected
SOV1	YMR066W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GAD1	Q04792	585 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	THI7	Q05998	598 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	FRE5	Q08908	694 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TGL5	Q12043	749 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	APC11	Q12157	165 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		0.42	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	COB	P00163	385 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	BI4	P03879	638 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SAM35	P14693	329 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	HEM3	P28789	327 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	FUN30	P31380	1131 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	THI80	P35202	319 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	PIH1	P38768	344 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MSS4	P38994	779 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	BOL3	P39724	118 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	HUL4	P40985	892 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GAT1	P43574	510 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YGL176C	P46945	554 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	POL32	P47110	350 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ROD1	Q02805	837 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	RMD1	Q03441	430 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NUT2	Q06213	157 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	CRT10	Q08226	957 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YDL177C	Q12257	170 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NDJ1	Q12366	352 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NPC2	Q12408	173 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TRM11	Q12463	433 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	BI2	P03873	423 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YER152C	P10356	443 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ERG11	P10614	530 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	VPS34	P22543	875 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NTH1	P32356	751 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	DCG1	P32460	244 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	APL3	P38065	1025 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	LNP1	P38878	278 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	YJL206C	P39529	758 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	JHD1	P40034	492 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	ELO3	P40319	345 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SIW14	P53965	281 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	GDE1	Q02979	1223 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	SEG1	Q04279	960 aa		0.41	□□□□□ -2.34
SOV1	YMR066W	TMN2	Q04562	672 aa		0.41	□□□□□ -2.34

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