RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C YIL165CP40446 119 aa7.39□□□□□ -1.23
SHO1YER118C CAF16P43569 289 aa7.39□□□□□ -1.23
SHO1YER118C CCT8P47079 568 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SHO1YER118C SLD3P53135 668 aa7.39□□□□□ -1.23
SHO1YER118C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SHO1YER118C EIS1Q05050 843 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SHO1YER118C PEX15Q08215 383 aa7.39□□□□□ -1.23
SHO1YER118C SAN1P22470 610 aa7.38□□□□□ -1.23
SHO1YER118C PPH3P32345 308 aa7.38□□□□□ -1.23
SHO1YER118C IRE1P32361 1115 aa7.38□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YTA6P40328 754 aa7.38□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YGR153WP48238 217 aa7.38□□□□□ -1.23
SHO1YER118C BLS1Q06071 122 aa7.38□□□□□ -1.23
SHO1YER118C EST2Q06163 884 aa7.38□□□□□ -1.23
SHO1YER118C RPS31P05759 152 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C IDI1P15496 288 aa7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C PET309P32522 965 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YBL086CP38177 466 aa7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C GPD2P41911 440 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C CNM67P53865 581 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C SKY1Q03656 742 aa7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C NSE5Q03718 556 aa7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C ATG33Q06485 197 aa7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C RSC58Q07979 502 aa7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YOL114CQ12322 202 aa7.37□□□□□ -1.23
SHO1YER118C HMG1P12683 1054 aa7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C SEC18P18759 758 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C EXO5P38289 585 aa7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C SAP30P38429 201 aa7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C CCT5P40413 562 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C MPH1P40562 993 aa7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C BTN2P53286 410 aa7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C BNI4P53858 892 aa7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C ECM9Q02202 377 aa7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C PKH1Q03407 766 aa7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C BRE4Q07660 1125 aa7.36□□□□□ -1.23
SHO1YER118C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data7.35□□□□□ -1.23 RIP-Chip
SHO1YER118C ENA1P13587 1091 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C GFA1P14742 717 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C RET1P22276 1149 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C HOG1P32485 435 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C DHR2P36009 735 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C RXT2P38255 430 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C UBS1P38290 277 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C ARH1P48360 493 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C UPF3P48412 387 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C HNT2P49775 206 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C AIM14P53109 570 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C ENA2Q01896 1091 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YLR287CQ05881 355 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YPR015CQ12531 247 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C ENA5Q12691 1091 aa7.35□□□□□ -1.23
SHO1YER118C SPO16P17122 198 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C FUR1P18562 216 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C AAD3P25612 363 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YKU70P32807 602 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YKL100CP34248 587 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C MDJ1P35191 511 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C MUD2P36084 527 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C NOP16P40007 231 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C RAD26P40352 1085 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C ATP22P50273 684 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C RBG2P53295 368 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YDR338CQ05497 695 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C PUS5Q06244 254 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C RSC3Q06639 885 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C HIM1Q06674 414 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C YPR027CQ12079 277 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C DPH6Q12429 685 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C ENT1Q12518 454 aa7.34□□□□□ -1.23
SHO1YER118C BI4P03879 638 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C NAT1P12945 854 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C PGS1P25578 521 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C RAD16P31244 790 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C FUN30P31380 1131 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C PAH1P32567 862 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SEG2P34250 1132 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C GYP8P43570 497 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C RET2P43621 546 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C JJJ2P46997 583 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C ARA2Q04212 335 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C LCD1Q04377 747 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C GSF2Q04697 403 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C DUS3Q06053 668 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C SGD1Q06132 899 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C GUP2Q08929 609 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C TCB1Q12466 1186 aa7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SHO1YER118C AAC3P18238 307 aa7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C MCD4P36051 919 aa7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C YKL077WP36081 392 aa7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C YML6P51998 286 aa7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C YAP1802P53309 568 aa7.32□□□□□ -1.24
SHO1YER118C CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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