RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	RER1	P25560	188 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PPH3	P32345	308 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SCT1	P32784	759 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PXA2	P34230	853 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RDH54	P38086	958 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YBR284W	P38150	797 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	GIP1	P38229	639 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	BIT2	P38346	545 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TLG1	Q03322	224 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SCM3	Q12334	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SPO21	Q12411	609 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	MRP7	P12687	371 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	STE6	P12866	1290 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	DAL3	P32459	195 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SPC29	P33419	253 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YKL107W	P34251	309 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RXT2	P38255	430 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	AIM46	P38885	310 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YGL176C	P46945	554 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YNL165W	P53891	406 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PEX13	P80667	386 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	ROD1	Q02805	837 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	MSH3	P25336	1018 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PET10	P36139	283 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	EMP65	P40085	556 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	ALG2	P43636	503 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	GRX3	Q03835	250 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	CIA1	Q05583	330 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	GUD1	Q07729	489 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SPO14	P36126	1683 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YER152C	P10356	443 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	IDI1	P15496	288 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	MKS1	P34072	584 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YKL100C	P34248	587 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PSY4	P38193	441 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	BSD2	P38356	321 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	COG8	Q04632	607 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
SYF1	YDR416W	SPO16	P17122	198 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	MLF3	P32047	452 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	BTN2	P53286	410 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	NSE5	Q03718	556 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SPT7	P35177	1332 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SAN1	P22470	610 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	AAD3	P25612	363 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SSM4	P40318	1319 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	KAP122	P32767	1081 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RIM11	P38615	370 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	CAF16	P43569	289 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	BFA1	P47113	574 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SLD3	P53135	668 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RSC58	Q07979	502 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	HSP42	Q12329	375 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RPC31	P17890	251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
SYF1	YDR416W	DID4	P36108	232 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RAD16	P31244	790 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SIT1	P39980	628 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
SYF1	YDR416W	YML6	P51998	286 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	VTI1	Q04338	217 aa		4.65	□□□□□ -1.66

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