RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W CRP1P38845 465 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W GEM1P39722 662 aa6.63□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W DSE4P53753 1117 aa6.63□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W UGO1Q03327 502 aa6.63□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W YOR223WQ12015 292 aa6.63□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W SFP1P32432 683 aa6.62□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W UBP12P39538 1254 aa6.62□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W GDH3P39708 457 aa6.62□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W DNF2Q12675 1612 aa6.62□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W IML1P47170 1584 aa6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W ADR1P07248 1323 aa6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W TOM70P07213 617 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W SPE2P21182 396 aa6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data6.61□□□□□ -1.35not detected
VHS1YDR247W JJJ3P47138 172 aa6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W EAF7P53911 425 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W GIC2Q06648 383 aa6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W YDL144CQ07589 356 aa6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W SPO21Q12411 609 aa6.61□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W YER152CP10356 443 aa6.6□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W RET1P22276 1149 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W PEX6P33760 1030 aa6.6□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W PNT1P38969 423 aa6.6□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W RPL8AP17076 256 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W KIP1P28742 1111 aa6.59□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W PPH3P32345 308 aa6.59□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W DOM34P33309 386 aa6.59□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W NNK1P36003 928 aa6.59□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W YBR284WP38150 797 aa6.59□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W MET5P47169 1442 aa6.59□□□□□ -1.35
VHS1YDR247W RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W TOP3P13099 656 aa6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W SUI2P20459 304 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W SIT1P39980 628 aa6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YEN1P40028 759 aa6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W UBP6P43593 499 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W MAL11P53048 616 aa6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W TFB2Q02939 513 aa6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YDL176WQ12027 708 aa6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W SNF2P22082 1703 aa6.58□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W PET10P36139 283 aa6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W GPB2P39717 880 aa6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W DPH6Q12429 685 aa6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W MSD1P15179 658 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W SMY2P32909 740 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W RRM3P38766 723 aa6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YIR014WP40570 242 aa6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YPR071WQ12346 211 aa6.57□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W ADE8P04161 214 aa6.56□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W DBP2P24783 546 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YAP3P38749 330 aa6.56□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W RPN3P40016 523 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W MXR1P40029 184 aa6.56□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YJR008WP47085 338 aa6.56□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W GSY1P23337 708 aa6.55□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W GPT2P36148 743 aa6.55□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YRO2P38079 344 aa6.55□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W MPP10P47083 593 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W HLJ1P48353 224 aa6.55□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W NCE103P53615 221 aa6.55□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W MDM12Q92328 271 aa6.55□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W DSS1P39112 969 aa6.54□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W YJL045WP47052 634 aa6.54□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W ACM1Q08981 209 aa6.54□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W RAD53P22216 821 aa6.53□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W MEF1P25039 761 aa6.53□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W CDC12P32468 407 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W NMD3P38861 518 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W ALG2P43636 503 aa6.53□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W RTS3P53289 263 aa6.53□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W LCD1Q04377 747 aa6.53□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W HPF1Q05164 967 aa6.53□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W ATG13Q06628 738 aa6.53□□□□□ -1.36
VHS1YDR247W PRO1P32264 428 aa6.52□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W SAH1P39954 449 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W YNL193WP53870 558 aa6.52□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W TPP1Q03796 238 aa6.52□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data6.51□□□□□ -1.37not detected
VHS1YDR247W SLA2P33338 968 aa6.51□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W BOI2P39969 1040 aa6.51□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W PMT3P47190 753 aa6.51□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W TNA1P53322 534 aa6.51□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
VHS1YDR247W RAD9P14737 1309 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.9 ms