RNA–Protein interactions for RNA: YCL008C

STP22, Transcript of Component of the ESCRT-I complex, yeast

Gene STP22, Length 1,158 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STP22	YCL008C	SHE9	Q04172	456 aa		5.06	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	AIM26	P32858	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	STE5	P32917	917 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	MAC1	P35192	417 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	MBP1	P39678	833 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	BUD3	P25558	1636 aa		5.05	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	HSP78	P33416	811 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	OPY1	P38271	328 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
STP22	YCL008C	CDC45	Q08032	650 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	ACM1	Q08981	209 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	LTE1	P07866	1435 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	YSP2	Q06681	1438 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	YOR093C	Q12275	1648 aa		5.04	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	SLA2	P33338	968 aa		5.03	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	MRP8	P35719	219 aa		5.03	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	TAF5	P38129	798 aa		5.03	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	NNF1	P47149	201 aa		5.03	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	ORC3	P54790	616 aa		5.03	□□□□□ -1.6
STP22	YCL008C	UGA2	P38067	497 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	YBR184W	P38299	523 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	GEM1	P39722	662 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	RSB1	Q08417	382 aa		5.02	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	RTC1	Q08281	1341 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	PBY1	P38254	753 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	OCA5	P38738	679 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	IRR1	P40541	1150 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	YJL049W	P47048	450 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	SPO14	P36126	1683 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	RAV1	P47104	1357 aa		5.01	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	BI4	P03879	638 aa		5	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	SPS1	P08458	490 aa		5	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	RAD4	P14736	754 aa		5	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	PFD1	P46988	109 aa		5	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	SCT1	P32784	759 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	LRG1	P35688	1017 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	YKL151C	P36059	337 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	ESL2	P36168	1195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	ATG13	Q06628	738 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	FMP25	Q08023	583 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	SVS1	Q12254	260 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	DFG16	Q99234	619 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	ACE2	P21192	770 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	IOC3	P43596	787 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
STP22	YCL008C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	DRS2	P39524	1355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	MNN4	P36044	1178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	MTC3	P53077	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
STP22	YCL008C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	PDR11	P40550	1411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STP22	YCL008C	BNR1	P40450	1375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	RFC5	P38251	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	RRT14	P40470	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	YIR014W	P40570	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	TIM54	P47045	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	HUL5	P53119	910 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	NSE3	Q05541	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	BDF2	Q07442	638 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SPO75	Q07798	868 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	HFM1	P51979	1187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	ENV11	P53246	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
STP22	YCL008C	MDM38	Q08179	573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	DOP1	Q03921	1698 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STP22	YCL008C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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