RNA–Protein interactions for RNA: YAL016W

TPD3, Transcript of Regulatory subunit A of the heterotrimeric PP2A complex, yeast

Gene TPD3, Length 1,908 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPD3	YAL016W	LYS5	P50113	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ATP25	Q03153	612 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ATG33	Q06485	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	AEP2	P22136	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	EMC3	P36039	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	HOG1	P32485	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	NIC96	P34077	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	DAM1	P53267	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	ACM1	Q08981	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	TRK1	P12685	1235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	UGA2	P38067	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YJL045W	P47052	634 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GIS4	Q04233	774 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	GUP2	Q08929	609 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TPD3	YAL016W	SAC7	P17121	654 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	PTP2	P29461	750 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	NPP2	P39997	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	VID27	P40157	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	NCE103	P53615	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	COG4	Q06096	861 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	GCR2	Q01722	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	COG8	Q04632	607 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MIH1	P23748	554 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	KCC4	P25389	1037 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	CEM1	P39525	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	BRE2	P43132	505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	YGR153W	P48238	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	NIT3	P49954	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	PHM6	Q05637	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	SLP1	Q12232	587 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	RMP1	Q12530	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MDJ1	P35191	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	ECM9	Q02202	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MDM38	Q08179	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	BI4	P03879	638 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	KTR4	P38131	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	ALG14	P38242	237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	EXO84	P38261	753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	BIT2	P38346	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	YER158C	P40095	573 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	GYP7	P48365	746 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	NHX1	Q04121	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	NNK1	P36003	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	RIM4	P38741	713 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	GIC1	P38785	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	TAD1	P53065	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MTC3	P53077	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	SFB2	P53953	876 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MLC2	Q06580	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	SNF5	P18480	905 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	DAL7	P21826	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	YCL002C	P25565	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	YKL133C	P36066	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	YHL041W	P38730	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	TDA3	P38758	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TPD3	YAL016W	AIM21	P40563	679 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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