RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 OPLAHO14841 1288 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 NR3C2P08235 984 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 TEAD4Q15561 434 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 RTN1Q16799 776 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 CNKSR1Q969H4 720 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 GMLQ99445 158 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.42□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 A6NHS1 94 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ADH1CP00326 375 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 NOS2P35228 1153 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 NBPF15Q8N660 670 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 GPR152Q8TDT2 470 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ARMC5Q96C12 935 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 IFT43Q96FT9 208 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-209ENST00000504994 ANKRD62A6NC57 917 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 MPNDQ8N594 471 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 PIF1Q9H611 641 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 CABP1Q9NZU7 370 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 SIAH2O43255 324 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 ADH1AP07327 375 aa7.38□□□□□ -1.23
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HERC3-209ENST00000504994 PI16Q6UXB8 463 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 ZNF662Q6ZS27 426 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 USP48Q86UV5 1035 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 TREML1Q86YW5 311 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 FRMD6Q96NE9 622 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 SPG7Q9UQ90 795 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 BCS1LQ9Y276 419 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 RPIAP49247 311 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 ARID5AQ03989 594 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 CLN3Q13286 438 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 C8orf34Q49A92 452 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.37□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 CENPCQ03188 943 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 FGRP09769 529 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 PCSK2P16519 638 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 IRS1P35568 1242 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 TXLNAP40222 546 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 RBL2Q08999 1139 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 CBLBQ13191 982 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 C12orf49Q9H741 205 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 TLDC2A0PJX2 215 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 GGT7Q9UJ14 662 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 TBX22Q9Y458 520 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-209ENST00000504994 USP31Q70CQ4 1352 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 NEFLP07196 543 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 KLRG1Q96E93 195 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 MEN1O00255 615 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 MICAL2O94851 1124 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 GJA8P48165 433 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-209ENST00000504994 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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