RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.62■□□□□ 0.41
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HERC3-209ENST00000504994 ADRA2BP18089 450 aa13.76□□□□□ -0.21
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HERC3-209ENST00000504994 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.01□□□□□ -0.33
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HERC3-209ENST00000504994 ZBTB22O15209 634 aa12.6□□□□□ -0.39
HERC3-209ENST00000504994 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.43□□□□□ -0.42
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HERC3-209ENST00000504994 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.17□□□□□ -0.46
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HERC3-209ENST00000504994 MSH5O43196 834 aa12.12□□□□□ -0.47
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HERC3-209ENST00000504994 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HERC3-209ENST00000504994 SLC4A2P04920 1241 aa11.85□□□□□ -0.51
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HERC3-209ENST00000504994 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.16□□□□□ -0.62
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HERC3-209ENST00000504994 APLP2Q06481 763 aa10.84□□□□□ -0.67
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HERC3-209ENST00000504994 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
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HERC3-209ENST00000504994 SPOCK2Q92563 424 aa10.59□□□□□ -0.71
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HERC3-209ENST00000504994 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.46□□□□□ -0.73
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HERC3-209ENST00000504994 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HERC3-209ENST00000504994 NBR1Q14596 966 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC3-209ENST00000504994 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC3-209ENST00000504994 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
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HERC3-209ENST00000504994 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.17□□□□□ -0.78
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