RNA–Protein interactions for RNA: YPR137W

RRP9, Transcript of Protein involved in pre-rRNA processing, yeast

Gene RRP9, Length 1,722 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP9	YPR137W	LCD1	Q04377	747 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RRP9	YPR137W	CSM3	Q04659	317 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RRP9	YPR137W	RAD59	Q12223	238 aa		7.21	□□□□□ -1.25
RRP9	YPR137W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	EPL1	P43572	832 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	DIP5	P53388	608 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	RET3	P53600	189 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	DSE4	P53753	1117 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	MFM1	Q02783	413 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	HIF1	Q12373	385 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	CLN3	P13365	580 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	OPY1	P38271	328 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	EAF5	P39995	279 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	COQ9	Q05779	260 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	SMC5	Q08204	1093 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	HFI1	Q12060	488 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	NCR1	Q12200	1170 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	PCD1	Q12524	340 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	ADK2	P26364	225 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	DSF2	P38213	736 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	UBX7	P38349	436 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	YHL026C	P38740	315 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	FIS1	P40515	155 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	YFL052W	P43551	465 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	WHI2	P12611	486 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	MBR1	P23493	339 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	MRPL7	P36519	292 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	ESL1	P40456	1118 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	BRE2	P43132	505 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	JJJ3	P47138	172 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	ALT2	P52892	507 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	ARP5	P53946	755 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	GSY1	P23337	708 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	YAP1801	P38856	637 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	YKE2	P52553	114 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	ROD1	Q02805	837 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	CEX1	Q12453	761 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	DMA1	P38823	416 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	HUL4	P40985	892 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	PIG1	Q06216	648 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	RLF2	Q12495	606 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	RIF1	P29539	1916 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	PPZ1	P26570	692 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	APM2	P38700	605 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	COQ8	P27697	501 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	TMT1	P32643	299 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	ATG32	P40458	529 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	TPO2	P53283	614 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	TRS120	Q04183	1289 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RRP9	YPR137W	SRD1	P09007	221 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	CDC6	P09119	513 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	CSE2	P33308	149 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	YHR202W	P38887	602 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	CCC2	P38995	1004 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	FYV10	P40492	516 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	LAM5	P43560	674 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	YJL045W	P47052	634 aa		7.15	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	KEX2	P13134	814 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	CBP3	P21560	335 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	ATG19	P35193	415 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	YGL081W	P53156	320 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	YLR407W	Q06070	228 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	PGA2	P53903	129 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	SPP1	Q03012	353 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	YLH47	Q06493	454 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	YOR022C	Q12204	715 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	GLN3	P18494	730 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	ASF1	P32447	279 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	XDJ1	P39102	459 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	YIR016W	P40572	265 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	SGO1	Q08490	590 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RRP9	YPR137W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.13	□□□□□ -1.27	not detected

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